Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N7

KLHL13, Kelch-like protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL13Q9P2N7 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC13.62□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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