Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
USP35Q9P2H5 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
USP35Q9P2H5 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
USP35Q9P2H5 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
USP35Q9P2H5 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
USP35Q9P2H5 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
USP35Q9P2H5 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
USP35Q9P2H5 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
USP35Q9P2H5 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
USP35Q9P2H5 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
USP35Q9P2H5 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
USP35Q9P2H5 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
USP35Q9P2H5 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
USP35Q9P2H5 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
USP35Q9P2H5 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
USP35Q9P2H5 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
USP35Q9P2H5 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
USP35Q9P2H5 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
USP35Q9P2H5 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
USP35Q9P2H5 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
USP35Q9P2H5 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
USP35Q9P2H5 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
USP35Q9P2H5 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
USP35Q9P2H5 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
USP35Q9P2H5 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
USP35Q9P2H5 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
USP35Q9P2H5 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
USP35Q9P2H5 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
USP35Q9P2H5 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
USP35Q9P2H5 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
USP35Q9P2H5 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
USP35Q9P2H5 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
USP35Q9P2H5 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
USP35Q9P2H5 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
USP35Q9P2H5 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
USP35Q9P2H5 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
USP35Q9P2H5 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
USP35Q9P2H5 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
USP35Q9P2H5 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
USP35Q9P2H5 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
USP35Q9P2H5 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
USP35Q9P2H5 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
USP35Q9P2H5 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
USP35Q9P2H5 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
USP35Q9P2H5 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
USP35Q9P2H5 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
USP35Q9P2H5 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
USP35Q9P2H5 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
USP35Q9P2H5 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
USP35Q9P2H5 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
USP35Q9P2H5 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
USP35Q9P2H5 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
USP35Q9P2H5 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
USP35Q9P2H5 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
USP35Q9P2H5 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
USP35Q9P2H5 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
USP35Q9P2H5 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
USP35Q9P2H5 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
USP35Q9P2H5 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
USP35Q9P2H5 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
USP35Q9P2H5 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
USP35Q9P2H5 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
USP35Q9P2H5 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
USP35Q9P2H5 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
USP35Q9P2H5 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
USP35Q9P2H5 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
USP35Q9P2H5 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
USP35Q9P2H5 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.83
USP35Q9P2H5 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
USP35Q9P2H5 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
USP35Q9P2H5 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
USP35Q9P2H5 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
USP35Q9P2H5 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
USP35Q9P2H5 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
USP35Q9P2H5 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
USP35Q9P2H5 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
USP35Q9P2H5 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
USP35Q9P2H5 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
USP35Q9P2H5 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
USP35Q9P2H5 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
USP35Q9P2H5 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
USP35Q9P2H5 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
USP35Q9P2H5 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
USP35Q9P2H5 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
USP35Q9P2H5 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
USP35Q9P2H5 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
USP35Q9P2H5 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
USP35Q9P2H5 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
USP35Q9P2H5 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
USP35Q9P2H5 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
USP35Q9P2H5 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
USP35Q9P2H5 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
USP35Q9P2H5 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
USP35Q9P2H5 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
USP35Q9P2H5 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
USP35Q9P2H5 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
USP35Q9P2H5 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
USP35Q9P2H5 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
USP35Q9P2H5 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
USP35Q9P2H5 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
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