Protein–RNA interactions for Protein: Q9P275

USP36, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,121 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP36Q9P275 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
USP36Q9P275 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
USP36Q9P275 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
USP36Q9P275 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
USP36Q9P275 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
USP36Q9P275 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
USP36Q9P275 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
USP36Q9P275 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
USP36Q9P275 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
USP36Q9P275 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
USP36Q9P275 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
USP36Q9P275 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
USP36Q9P275 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
USP36Q9P275 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
USP36Q9P275 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
USP36Q9P275 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
USP36Q9P275 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
USP36Q9P275 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
USP36Q9P275 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
USP36Q9P275 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
USP36Q9P275 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
USP36Q9P275 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
USP36Q9P275 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
USP36Q9P275 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
USP36Q9P275 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
USP36Q9P275 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
USP36Q9P275 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
USP36Q9P275 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
USP36Q9P275 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
USP36Q9P275 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
USP36Q9P275 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
USP36Q9P275 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
USP36Q9P275 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
USP36Q9P275 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
USP36Q9P275 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
USP36Q9P275 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
USP36Q9P275 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
USP36Q9P275 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
USP36Q9P275 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
USP36Q9P275 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
USP36Q9P275 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
USP36Q9P275 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
USP36Q9P275 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
USP36Q9P275 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
USP36Q9P275 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
USP36Q9P275 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
USP36Q9P275 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
USP36Q9P275 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
USP36Q9P275 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
USP36Q9P275 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
USP36Q9P275 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
USP36Q9P275 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
USP36Q9P275 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
USP36Q9P275 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
USP36Q9P275 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
USP36Q9P275 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
USP36Q9P275 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
USP36Q9P275 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
USP36Q9P275 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
USP36Q9P275 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
USP36Q9P275 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
USP36Q9P275 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
USP36Q9P275 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
USP36Q9P275 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
USP36Q9P275 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
USP36Q9P275 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
USP36Q9P275 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
USP36Q9P275 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
USP36Q9P275 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
USP36Q9P275 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
USP36Q9P275 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
USP36Q9P275 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
USP36Q9P275 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
USP36Q9P275 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
USP36Q9P275 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
USP36Q9P275 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
USP36Q9P275 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
USP36Q9P275 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
USP36Q9P275 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
USP36Q9P275 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
USP36Q9P275 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
USP36Q9P275 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
USP36Q9P275 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
USP36Q9P275 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
USP36Q9P275 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
USP36Q9P275 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
USP36Q9P275 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
USP36Q9P275 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
USP36Q9P275 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
USP36Q9P275 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
USP36Q9P275 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
USP36Q9P275 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
USP36Q9P275 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
USP36Q9P275 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
USP36Q9P275 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
USP36Q9P275 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
USP36Q9P275 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
USP36Q9P275 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
USP36Q9P275 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
USP36Q9P275 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms