Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX08

COMMD8, COMM domain-containing protein 8, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD8Q9NX08 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
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