Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS6

SNX15, Sorting nexin-15, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX15Q9NRS6 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
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SNX15Q9NRS6 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SNX15Q9NRS6 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SNX15Q9NRS6 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SNX15Q9NRS6 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
SNX15Q9NRS6 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SNX15Q9NRS6 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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SNX15Q9NRS6 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SNX15Q9NRS6 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SNX15Q9NRS6 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SNX15Q9NRS6 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SNX15Q9NRS6 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SNX15Q9NRS6 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SNX15Q9NRS6 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SNX15Q9NRS6 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SNX15Q9NRS6 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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SNX15Q9NRS6 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SNX15Q9NRS6 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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SNX15Q9NRS6 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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SNX15Q9NRS6 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SNX15Q9NRS6 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SNX15Q9NRS6 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SNX15Q9NRS6 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SNX15Q9NRS6 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SNX15Q9NRS6 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SNX15Q9NRS6 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SNX15Q9NRS6 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SNX15Q9NRS6 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SNX15Q9NRS6 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SNX15Q9NRS6 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SNX15Q9NRS6 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SNX15Q9NRS6 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
SNX15Q9NRS6 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SNX15Q9NRS6 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SNX15Q9NRS6 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SNX15Q9NRS6 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SNX15Q9NRS6 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SNX15Q9NRS6 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SNX15Q9NRS6 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
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