Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRB3

CHST12, Carbohydrate sulfotransferase 12, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST12Q9NRB3 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHST12Q9NRB3 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHST12Q9NRB3 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHST12Q9NRB3 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHST12Q9NRB3 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHST12Q9NRB3 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHST12Q9NRB3 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHST12Q9NRB3 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHST12Q9NRB3 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHST12Q9NRB3 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHST12Q9NRB3 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHST12Q9NRB3 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHST12Q9NRB3 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHST12Q9NRB3 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHST12Q9NRB3 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CHST12Q9NRB3 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHST12Q9NRB3 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHST12Q9NRB3 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHST12Q9NRB3 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CHST12Q9NRB3 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CHST12Q9NRB3 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHST12Q9NRB3 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHST12Q9NRB3 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHST12Q9NRB3 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHST12Q9NRB3 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHST12Q9NRB3 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHST12Q9NRB3 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHST12Q9NRB3 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHST12Q9NRB3 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHST12Q9NRB3 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHST12Q9NRB3 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHST12Q9NRB3 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHST12Q9NRB3 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHST12Q9NRB3 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHST12Q9NRB3 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHST12Q9NRB3 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHST12Q9NRB3 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHST12Q9NRB3 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHST12Q9NRB3 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHST12Q9NRB3 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHST12Q9NRB3 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHST12Q9NRB3 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHST12Q9NRB3 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHST12Q9NRB3 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHST12Q9NRB3 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHST12Q9NRB3 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHST12Q9NRB3 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHST12Q9NRB3 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHST12Q9NRB3 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHST12Q9NRB3 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHST12Q9NRB3 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHST12Q9NRB3 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHST12Q9NRB3 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHST12Q9NRB3 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHST12Q9NRB3 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CHST12Q9NRB3 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHST12Q9NRB3 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHST12Q9NRB3 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHST12Q9NRB3 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHST12Q9NRB3 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHST12Q9NRB3 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CHST12Q9NRB3 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHST12Q9NRB3 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CHST12Q9NRB3 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHST12Q9NRB3 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHST12Q9NRB3 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHST12Q9NRB3 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHST12Q9NRB3 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CHST12Q9NRB3 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CHST12Q9NRB3 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHST12Q9NRB3 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHST12Q9NRB3 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHST12Q9NRB3 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHST12Q9NRB3 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHST12Q9NRB3 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHST12Q9NRB3 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHST12Q9NRB3 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHST12Q9NRB3 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.9 ms