Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQG7

HPS4, Hermansky-Pudlak syndrome 4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS4Q9NQG7 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HPS4Q9NQG7 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HPS4Q9NQG7 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HPS4Q9NQG7 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HPS4Q9NQG7 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HPS4Q9NQG7 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HPS4Q9NQG7 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HPS4Q9NQG7 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HPS4Q9NQG7 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HPS4Q9NQG7 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HPS4Q9NQG7 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HPS4Q9NQG7 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HPS4Q9NQG7 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HPS4Q9NQG7 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HPS4Q9NQG7 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HPS4Q9NQG7 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HPS4Q9NQG7 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HPS4Q9NQG7 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HPS4Q9NQG7 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HPS4Q9NQG7 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HPS4Q9NQG7 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HPS4Q9NQG7 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HPS4Q9NQG7 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HPS4Q9NQG7 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HPS4Q9NQG7 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HPS4Q9NQG7 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HPS4Q9NQG7 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HPS4Q9NQG7 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HPS4Q9NQG7 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HPS4Q9NQG7 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HPS4Q9NQG7 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HPS4Q9NQG7 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HPS4Q9NQG7 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HPS4Q9NQG7 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HPS4Q9NQG7 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HPS4Q9NQG7 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HPS4Q9NQG7 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HPS4Q9NQG7 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HPS4Q9NQG7 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HPS4Q9NQG7 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HPS4Q9NQG7 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HPS4Q9NQG7 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HPS4Q9NQG7 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HPS4Q9NQG7 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HPS4Q9NQG7 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HPS4Q9NQG7 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HPS4Q9NQG7 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HPS4Q9NQG7 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HPS4Q9NQG7 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HPS4Q9NQG7 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HPS4Q9NQG7 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HPS4Q9NQG7 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HPS4Q9NQG7 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HPS4Q9NQG7 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HPS4Q9NQG7 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HPS4Q9NQG7 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HPS4Q9NQG7 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HPS4Q9NQG7 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HPS4Q9NQG7 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HPS4Q9NQG7 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HPS4Q9NQG7 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HPS4Q9NQG7 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HPS4Q9NQG7 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HPS4Q9NQG7 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HPS4Q9NQG7 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HPS4Q9NQG7 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HPS4Q9NQG7 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HPS4Q9NQG7 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HPS4Q9NQG7 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HPS4Q9NQG7 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HPS4Q9NQG7 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HPS4Q9NQG7 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HPS4Q9NQG7 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HPS4Q9NQG7 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HPS4Q9NQG7 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HPS4Q9NQG7 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HPS4Q9NQG7 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HPS4Q9NQG7 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HPS4Q9NQG7 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HPS4Q9NQG7 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HPS4Q9NQG7 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HPS4Q9NQG7 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HPS4Q9NQG7 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HPS4Q9NQG7 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HPS4Q9NQG7 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HPS4Q9NQG7 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HPS4Q9NQG7 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HPS4Q9NQG7 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HPS4Q9NQG7 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HPS4Q9NQG7 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HPS4Q9NQG7 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HPS4Q9NQG7 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HPS4Q9NQG7 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HPS4Q9NQG7 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HPS4Q9NQG7 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HPS4Q9NQG7 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HPS4Q9NQG7 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HPS4Q9NQG7 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HPS4Q9NQG7 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HPS4Q9NQG7 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms