Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP61

ARFGAP3, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGAP3Q9NP61 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 SAMD15-201ENST00000216471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 FZD6-206ENST00000523739 2774 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 DAGLB-201ENST00000297056 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 ABLIM2-213ENST00000514025 2974 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 TP53I11-222ENST00000616990 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 RIN3-201ENST00000216487 3859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 PELP1-202ENST00000436683 3524 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 AL512306.2-201ENST00000444037 2219 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 SCD5-202ENST00000319540 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 KIFC3-202ENST00000421376 3128 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 EHMT2-204ENST00000395728 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 NUTM2HP-201ENST00000442076 2498 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 HADH-202ENST00000403312 1752 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 TET3-201ENST00000305799 5174 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 MOB3C-203ENST00000371940 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 PSME3-203ENST00000541124 3366 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 IL20RA-207ENST00000541547 3382 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 CHD1-212ENST00000614616 8095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms