Protein–RNA interactions for Protein: Q9HDB9

ERVK-5, Endogenous retrovirus group K member 5 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-5Q9HDB9 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVK-5Q9HDB9 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVK-5Q9HDB9 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVK-5Q9HDB9 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVK-5Q9HDB9 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVK-5Q9HDB9 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVK-5Q9HDB9 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVK-5Q9HDB9 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVK-5Q9HDB9 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVK-5Q9HDB9 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVK-5Q9HDB9 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVK-5Q9HDB9 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVK-5Q9HDB9 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVK-5Q9HDB9 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVK-5Q9HDB9 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVK-5Q9HDB9 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVK-5Q9HDB9 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVK-5Q9HDB9 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVK-5Q9HDB9 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVK-5Q9HDB9 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVK-5Q9HDB9 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVK-5Q9HDB9 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVK-5Q9HDB9 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVK-5Q9HDB9 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVK-5Q9HDB9 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVK-5Q9HDB9 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVK-5Q9HDB9 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVK-5Q9HDB9 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVK-5Q9HDB9 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVK-5Q9HDB9 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVK-5Q9HDB9 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ERVK-5Q9HDB9 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ERVK-5Q9HDB9 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ERVK-5Q9HDB9 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ERVK-5Q9HDB9 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ERVK-5Q9HDB9 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ERVK-5Q9HDB9 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ERVK-5Q9HDB9 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ERVK-5Q9HDB9 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ERVK-5Q9HDB9 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVK-5Q9HDB9 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVK-5Q9HDB9 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVK-5Q9HDB9 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVK-5Q9HDB9 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVK-5Q9HDB9 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVK-5Q9HDB9 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVK-5Q9HDB9 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVK-5Q9HDB9 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVK-5Q9HDB9 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVK-5Q9HDB9 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVK-5Q9HDB9 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVK-5Q9HDB9 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVK-5Q9HDB9 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVK-5Q9HDB9 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVK-5Q9HDB9 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVK-5Q9HDB9 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVK-5Q9HDB9 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVK-5Q9HDB9 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVK-5Q9HDB9 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVK-5Q9HDB9 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVK-5Q9HDB9 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVK-5Q9HDB9 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVK-5Q9HDB9 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVK-5Q9HDB9 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVK-5Q9HDB9 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVK-5Q9HDB9 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVK-5Q9HDB9 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVK-5Q9HDB9 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVK-5Q9HDB9 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVK-5Q9HDB9 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVK-5Q9HDB9 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVK-5Q9HDB9 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVK-5Q9HDB9 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVK-5Q9HDB9 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVK-5Q9HDB9 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVK-5Q9HDB9 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVK-5Q9HDB9 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVK-5Q9HDB9 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVK-5Q9HDB9 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVK-5Q9HDB9 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVK-5Q9HDB9 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVK-5Q9HDB9 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVK-5Q9HDB9 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVK-5Q9HDB9 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVK-5Q9HDB9 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVK-5Q9HDB9 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVK-5Q9HDB9 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVK-5Q9HDB9 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVK-5Q9HDB9 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVK-5Q9HDB9 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVK-5Q9HDB9 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVK-5Q9HDB9 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVK-5Q9HDB9 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVK-5Q9HDB9 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVK-5Q9HDB9 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVK-5Q9HDB9 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVK-5Q9HDB9 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVK-5Q9HDB9 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVK-5Q9HDB9 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVK-5Q9HDB9 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms