Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG3

NIFK, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIFKQ9BYG3 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms