Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT4

TDRD1, Tudor domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD1Q9BXT4 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TDRD1Q9BXT4 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TDRD1Q9BXT4 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TDRD1Q9BXT4 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TDRD1Q9BXT4 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TDRD1Q9BXT4 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TDRD1Q9BXT4 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TDRD1Q9BXT4 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TDRD1Q9BXT4 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TDRD1Q9BXT4 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TDRD1Q9BXT4 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TDRD1Q9BXT4 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TDRD1Q9BXT4 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TDRD1Q9BXT4 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TDRD1Q9BXT4 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TDRD1Q9BXT4 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TDRD1Q9BXT4 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TDRD1Q9BXT4 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TDRD1Q9BXT4 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TDRD1Q9BXT4 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TDRD1Q9BXT4 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TDRD1Q9BXT4 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TDRD1Q9BXT4 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TDRD1Q9BXT4 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TDRD1Q9BXT4 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TDRD1Q9BXT4 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TDRD1Q9BXT4 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TDRD1Q9BXT4 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TDRD1Q9BXT4 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TDRD1Q9BXT4 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TDRD1Q9BXT4 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TDRD1Q9BXT4 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TDRD1Q9BXT4 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TDRD1Q9BXT4 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TDRD1Q9BXT4 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TDRD1Q9BXT4 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TDRD1Q9BXT4 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TDRD1Q9BXT4 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TDRD1Q9BXT4 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TDRD1Q9BXT4 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TDRD1Q9BXT4 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TDRD1Q9BXT4 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TDRD1Q9BXT4 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TDRD1Q9BXT4 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TDRD1Q9BXT4 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TDRD1Q9BXT4 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TDRD1Q9BXT4 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TDRD1Q9BXT4 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TDRD1Q9BXT4 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TDRD1Q9BXT4 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TDRD1Q9BXT4 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TDRD1Q9BXT4 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TDRD1Q9BXT4 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TDRD1Q9BXT4 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TDRD1Q9BXT4 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TDRD1Q9BXT4 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TDRD1Q9BXT4 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TDRD1Q9BXT4 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TDRD1Q9BXT4 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TDRD1Q9BXT4 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TDRD1Q9BXT4 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TDRD1Q9BXT4 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TDRD1Q9BXT4 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TDRD1Q9BXT4 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TDRD1Q9BXT4 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TDRD1Q9BXT4 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TDRD1Q9BXT4 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TDRD1Q9BXT4 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TDRD1Q9BXT4 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TDRD1Q9BXT4 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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