Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXF6

RAB11FIP5, Rab11 family-interacting protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP5Q9BXF6 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB11FIP5Q9BXF6 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.6 ms