Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUP0

EFHD1, EF-hand domain-containing protein D1, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHD1Q9BUP0 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EFHD1Q9BUP0 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
EFHD1Q9BUP0 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EFHD1Q9BUP0 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
EFHD1Q9BUP0 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
EFHD1Q9BUP0 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EFHD1Q9BUP0 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EFHD1Q9BUP0 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
EFHD1Q9BUP0 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EFHD1Q9BUP0 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EFHD1Q9BUP0 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EFHD1Q9BUP0 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
EFHD1Q9BUP0 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EFHD1Q9BUP0 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
EFHD1Q9BUP0 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
EFHD1Q9BUP0 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EFHD1Q9BUP0 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EFHD1Q9BUP0 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
EFHD1Q9BUP0 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
EFHD1Q9BUP0 FASN-206ENST00000634990 8407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
EFHD1Q9BUP0 LATS1-207ENST00000543571 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
EFHD1Q9BUP0 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
EFHD1Q9BUP0 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
EFHD1Q9BUP0 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
EFHD1Q9BUP0 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
EFHD1Q9BUP0 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
EFHD1Q9BUP0 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
EFHD1Q9BUP0 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
EFHD1Q9BUP0 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EFHD1Q9BUP0 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EFHD1Q9BUP0 PCM1-202ENST00000327578 8287 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
EFHD1Q9BUP0 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
EFHD1Q9BUP0 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EFHD1Q9BUP0 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EFHD1Q9BUP0 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EFHD1Q9BUP0 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EFHD1Q9BUP0 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EFHD1Q9BUP0 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC15.05■□□□□ -0
EFHD1Q9BUP0 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC15.05■□□□□ -0
EFHD1Q9BUP0 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EFHD1Q9BUP0 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
EFHD1Q9BUP0 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
EFHD1Q9BUP0 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
EFHD1Q9BUP0 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
EFHD1Q9BUP0 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
EFHD1Q9BUP0 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
EFHD1Q9BUP0 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EFHD1Q9BUP0 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EFHD1Q9BUP0 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EFHD1Q9BUP0 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
EFHD1Q9BUP0 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EFHD1Q9BUP0 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EFHD1Q9BUP0 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EFHD1Q9BUP0 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EFHD1Q9BUP0 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.05■□□□□ -0
EFHD1Q9BUP0 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
EFHD1Q9BUP0 POFUT1-202ENST00000375749 5235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EFHD1Q9BUP0 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
EFHD1Q9BUP0 PEG13-201ENST00000631594 5667 ntBASIC15.05■□□□□ -0
EFHD1Q9BUP0 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.05■□□□□ -0
EFHD1Q9BUP0 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
EFHD1Q9BUP0 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
EFHD1Q9BUP0 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EFHD1Q9BUP0 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
EFHD1Q9BUP0 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EFHD1Q9BUP0 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
EFHD1Q9BUP0 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EFHD1Q9BUP0 FLNC-201ENST00000325888 9188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EFHD1Q9BUP0 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EFHD1Q9BUP0 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
EFHD1Q9BUP0 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EFHD1Q9BUP0 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
EFHD1Q9BUP0 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EFHD1Q9BUP0 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EFHD1Q9BUP0 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EFHD1Q9BUP0 TNS2-202ENST00000314276 4944 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EFHD1Q9BUP0 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
EFHD1Q9BUP0 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EFHD1Q9BUP0 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
EFHD1Q9BUP0 LANCL3-202ENST00000378621 10298 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EFHD1Q9BUP0 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EFHD1Q9BUP0 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
EFHD1Q9BUP0 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EFHD1Q9BUP0 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EFHD1Q9BUP0 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
EFHD1Q9BUP0 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
EFHD1Q9BUP0 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
EFHD1Q9BUP0 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
EFHD1Q9BUP0 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
EFHD1Q9BUP0 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC15.04■□□□□ -0
EFHD1Q9BUP0 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
EFHD1Q9BUP0 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
EFHD1Q9BUP0 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC15.04■□□□□ -0
EFHD1Q9BUP0 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EFHD1Q9BUP0 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
EFHD1Q9BUP0 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC15.04■□□□□ -0
EFHD1Q9BUP0 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
EFHD1Q9BUP0 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
EFHD1Q9BUP0 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
EFHD1Q9BUP0 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.6 ms