Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSA9

TMEM175, Endosomal/lysosomal potassium channel TMEM175, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM175Q9BSA9 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM175Q9BSA9 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM175Q9BSA9 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM175Q9BSA9 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM175Q9BSA9 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM175Q9BSA9 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM175Q9BSA9 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM175Q9BSA9 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM175Q9BSA9 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM175Q9BSA9 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM175Q9BSA9 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM175Q9BSA9 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM175Q9BSA9 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM175Q9BSA9 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM175Q9BSA9 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM175Q9BSA9 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM175Q9BSA9 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM175Q9BSA9 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM175Q9BSA9 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM175Q9BSA9 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM175Q9BSA9 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM175Q9BSA9 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM175Q9BSA9 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM175Q9BSA9 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM175Q9BSA9 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM175Q9BSA9 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM175Q9BSA9 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM175Q9BSA9 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM175Q9BSA9 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM175Q9BSA9 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM175Q9BSA9 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM175Q9BSA9 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM175Q9BSA9 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM175Q9BSA9 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM175Q9BSA9 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM175Q9BSA9 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM175Q9BSA9 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM175Q9BSA9 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM175Q9BSA9 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM175Q9BSA9 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM175Q9BSA9 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM175Q9BSA9 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM175Q9BSA9 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM175Q9BSA9 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM175Q9BSA9 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM175Q9BSA9 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM175Q9BSA9 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM175Q9BSA9 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM175Q9BSA9 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM175Q9BSA9 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM175Q9BSA9 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM175Q9BSA9 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM175Q9BSA9 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM175Q9BSA9 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM175Q9BSA9 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM175Q9BSA9 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM175Q9BSA9 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM175Q9BSA9 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM175Q9BSA9 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM175Q9BSA9 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM175Q9BSA9 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM175Q9BSA9 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM175Q9BSA9 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM175Q9BSA9 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM175Q9BSA9 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM175Q9BSA9 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMEM175Q9BSA9 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMEM175Q9BSA9 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMEM175Q9BSA9 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMEM175Q9BSA9 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMEM175Q9BSA9 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMEM175Q9BSA9 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMEM175Q9BSA9 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMEM175Q9BSA9 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMEM175Q9BSA9 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMEM175Q9BSA9 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMEM175Q9BSA9 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMEM175Q9BSA9 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMEM175Q9BSA9 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMEM175Q9BSA9 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMEM175Q9BSA9 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMEM175Q9BSA9 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMEM175Q9BSA9 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM175Q9BSA9 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM175Q9BSA9 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM175Q9BSA9 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM175Q9BSA9 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM175Q9BSA9 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM175Q9BSA9 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM175Q9BSA9 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM175Q9BSA9 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM175Q9BSA9 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM175Q9BSA9 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM175Q9BSA9 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM175Q9BSA9 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM175Q9BSA9 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM175Q9BSA9 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM175Q9BSA9 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM175Q9BSA9 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM175Q9BSA9 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65 ms