Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SIN3AQ96ST3 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SIN3AQ96ST3 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SIN3AQ96ST3 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SIN3AQ96ST3 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SIN3AQ96ST3 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SIN3AQ96ST3 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SIN3AQ96ST3 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SIN3AQ96ST3 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SIN3AQ96ST3 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SIN3AQ96ST3 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SIN3AQ96ST3 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SIN3AQ96ST3 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SIN3AQ96ST3 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SIN3AQ96ST3 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SIN3AQ96ST3 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SIN3AQ96ST3 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SIN3AQ96ST3 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SIN3AQ96ST3 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SIN3AQ96ST3 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SIN3AQ96ST3 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SIN3AQ96ST3 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SIN3AQ96ST3 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SIN3AQ96ST3 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SIN3AQ96ST3 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SIN3AQ96ST3 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SIN3AQ96ST3 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SIN3AQ96ST3 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SIN3AQ96ST3 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SIN3AQ96ST3 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SIN3AQ96ST3 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SIN3AQ96ST3 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SIN3AQ96ST3 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SIN3AQ96ST3 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SIN3AQ96ST3 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SIN3AQ96ST3 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SIN3AQ96ST3 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SIN3AQ96ST3 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SIN3AQ96ST3 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SIN3AQ96ST3 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SIN3AQ96ST3 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SIN3AQ96ST3 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SIN3AQ96ST3 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SIN3AQ96ST3 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SIN3AQ96ST3 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SIN3AQ96ST3 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SIN3AQ96ST3 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SIN3AQ96ST3 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SIN3AQ96ST3 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SIN3AQ96ST3 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SIN3AQ96ST3 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SIN3AQ96ST3 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SIN3AQ96ST3 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SIN3AQ96ST3 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SIN3AQ96ST3 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SIN3AQ96ST3 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SIN3AQ96ST3 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SIN3AQ96ST3 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SIN3AQ96ST3 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SIN3AQ96ST3 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SIN3AQ96ST3 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SIN3AQ96ST3 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SIN3AQ96ST3 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SIN3AQ96ST3 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SIN3AQ96ST3 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SIN3AQ96ST3 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SIN3AQ96ST3 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SIN3AQ96ST3 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SIN3AQ96ST3 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SIN3AQ96ST3 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SIN3AQ96ST3 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SIN3AQ96ST3 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SIN3AQ96ST3 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SIN3AQ96ST3 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SIN3AQ96ST3 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SIN3AQ96ST3 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SIN3AQ96ST3 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SIN3AQ96ST3 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SIN3AQ96ST3 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SIN3AQ96ST3 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SIN3AQ96ST3 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SIN3AQ96ST3 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SIN3AQ96ST3 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SIN3AQ96ST3 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SIN3AQ96ST3 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SIN3AQ96ST3 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SIN3AQ96ST3 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SIN3AQ96ST3 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SIN3AQ96ST3 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SIN3AQ96ST3 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SIN3AQ96ST3 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SIN3AQ96ST3 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SIN3AQ96ST3 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SIN3AQ96ST3 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SIN3AQ96ST3 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SIN3AQ96ST3 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SIN3AQ96ST3 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SIN3AQ96ST3 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SIN3AQ96ST3 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SIN3AQ96ST3 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms