Protein–RNA interactions for Protein: Q96QF7

GCNA, Acidic repeat-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNAQ96QF7 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms