Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD1

SGCZ, Zeta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCZQ96LD1 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SGCZQ96LD1 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SGCZQ96LD1 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SGCZQ96LD1 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SGCZQ96LD1 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
SGCZQ96LD1 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
SGCZQ96LD1 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
SGCZQ96LD1 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
SGCZQ96LD1 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
SGCZQ96LD1 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
SGCZQ96LD1 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
SGCZQ96LD1 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
SGCZQ96LD1 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SGCZQ96LD1 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SGCZQ96LD1 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SGCZQ96LD1 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SGCZQ96LD1 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SGCZQ96LD1 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SGCZQ96LD1 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SGCZQ96LD1 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SGCZQ96LD1 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SGCZQ96LD1 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SGCZQ96LD1 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SGCZQ96LD1 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SGCZQ96LD1 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SGCZQ96LD1 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SGCZQ96LD1 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SGCZQ96LD1 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SGCZQ96LD1 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SGCZQ96LD1 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SGCZQ96LD1 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
SGCZQ96LD1 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SGCZQ96LD1 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SGCZQ96LD1 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SGCZQ96LD1 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SGCZQ96LD1 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SGCZQ96LD1 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
SGCZQ96LD1 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SGCZQ96LD1 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SGCZQ96LD1 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SGCZQ96LD1 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
SGCZQ96LD1 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SGCZQ96LD1 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SGCZQ96LD1 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
SGCZQ96LD1 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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SGCZQ96LD1 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
SGCZQ96LD1 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SGCZQ96LD1 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SGCZQ96LD1 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SGCZQ96LD1 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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SGCZQ96LD1 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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SGCZQ96LD1 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SGCZQ96LD1 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SGCZQ96LD1 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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SGCZQ96LD1 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SGCZQ96LD1 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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SGCZQ96LD1 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SGCZQ96LD1 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SGCZQ96LD1 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SGCZQ96LD1 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SGCZQ96LD1 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SGCZQ96LD1 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SGCZQ96LD1 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SGCZQ96LD1 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SGCZQ96LD1 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SGCZQ96LD1 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SGCZQ96LD1 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SGCZQ96LD1 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SGCZQ96LD1 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SGCZQ96LD1 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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SGCZQ96LD1 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SGCZQ96LD1 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SGCZQ96LD1 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SGCZQ96LD1 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SGCZQ96LD1 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SGCZQ96LD1 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SGCZQ96LD1 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SGCZQ96LD1 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SGCZQ96LD1 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SGCZQ96LD1 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SGCZQ96LD1 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
SGCZQ96LD1 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SGCZQ96LD1 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
SGCZQ96LD1 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SGCZQ96LD1 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SGCZQ96LD1 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
SGCZQ96LD1 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
SGCZQ96LD1 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SGCZQ96LD1 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SGCZQ96LD1 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SGCZQ96LD1 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SGCZQ96LD1 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SGCZQ96LD1 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SGCZQ96LD1 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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