Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70 ms