Protein–RNA interactions for Protein: Q96F63

CCDC97, Coiled-coil domain-containing protein 97, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC97Q96F63 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 NOTCH1-201ENST00000277541 9371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 CDH3-201ENST00000264012 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 MPP6-202ENST00000396475 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 SLX4-201ENST00000294008 7307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 ACTG1P22-201ENST00000603793 1099 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 ADGRG6-202ENST00000296932 6849 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 ZNF395-201ENST00000344423 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 SF3A1-201ENST00000215793 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 STRCP1-201ENST00000509801 5328 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms