Protein–RNA interactions for Protein: Q96DB2

HDAC11, Histone deacetylase 11, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC11Q96DB2 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms