Protein–RNA interactions for Protein: Q96C45

ULK4, Serine/threonine-protein kinase ULK4, humanhuman

Predictions only

Length 1,275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ULK4Q96C45 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ULK4Q96C45 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ULK4Q96C45 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ULK4Q96C45 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ULK4Q96C45 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ULK4Q96C45 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ULK4Q96C45 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ULK4Q96C45 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ULK4Q96C45 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ULK4Q96C45 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ULK4Q96C45 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ULK4Q96C45 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
ULK4Q96C45 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ULK4Q96C45 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ULK4Q96C45 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ULK4Q96C45 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ULK4Q96C45 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ULK4Q96C45 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ULK4Q96C45 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ULK4Q96C45 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ULK4Q96C45 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ULK4Q96C45 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ULK4Q96C45 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ULK4Q96C45 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ULK4Q96C45 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ULK4Q96C45 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ULK4Q96C45 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ULK4Q96C45 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ULK4Q96C45 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ULK4Q96C45 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ULK4Q96C45 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ULK4Q96C45 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ULK4Q96C45 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ULK4Q96C45 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ULK4Q96C45 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ULK4Q96C45 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ULK4Q96C45 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ULK4Q96C45 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ULK4Q96C45 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ULK4Q96C45 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ULK4Q96C45 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ULK4Q96C45 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ULK4Q96C45 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ULK4Q96C45 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ULK4Q96C45 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ULK4Q96C45 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ULK4Q96C45 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ULK4Q96C45 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ULK4Q96C45 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ULK4Q96C45 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ULK4Q96C45 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ULK4Q96C45 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ULK4Q96C45 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
ULK4Q96C45 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ULK4Q96C45 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ULK4Q96C45 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ULK4Q96C45 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ULK4Q96C45 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ULK4Q96C45 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ULK4Q96C45 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ULK4Q96C45 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ULK4Q96C45 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ULK4Q96C45 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ULK4Q96C45 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ULK4Q96C45 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ULK4Q96C45 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ULK4Q96C45 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ULK4Q96C45 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ULK4Q96C45 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ULK4Q96C45 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ULK4Q96C45 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ULK4Q96C45 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ULK4Q96C45 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ULK4Q96C45 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ULK4Q96C45 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ULK4Q96C45 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ULK4Q96C45 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ULK4Q96C45 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ULK4Q96C45 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ULK4Q96C45 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ULK4Q96C45 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ULK4Q96C45 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ULK4Q96C45 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ULK4Q96C45 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ULK4Q96C45 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ULK4Q96C45 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ULK4Q96C45 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ULK4Q96C45 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ULK4Q96C45 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ULK4Q96C45 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ULK4Q96C45 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ULK4Q96C45 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ULK4Q96C45 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ULK4Q96C45 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ULK4Q96C45 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ULK4Q96C45 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ULK4Q96C45 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ULK4Q96C45 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ULK4Q96C45 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ULK4Q96C45 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms