Protein–RNA interactions for Protein: Q969G3

SMARCE1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1Q969G3 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMARCE1Q969G3 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMARCE1Q969G3 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMARCE1Q969G3 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMARCE1Q969G3 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMARCE1Q969G3 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMARCE1Q969G3 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SMARCE1Q969G3 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMARCE1Q969G3 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMARCE1Q969G3 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMARCE1Q969G3 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMARCE1Q969G3 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMARCE1Q969G3 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMARCE1Q969G3 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMARCE1Q969G3 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMARCE1Q969G3 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMARCE1Q969G3 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMARCE1Q969G3 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMARCE1Q969G3 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMARCE1Q969G3 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMARCE1Q969G3 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMARCE1Q969G3 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMARCE1Q969G3 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMARCE1Q969G3 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SMARCE1Q969G3 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMARCE1Q969G3 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMARCE1Q969G3 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMARCE1Q969G3 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMARCE1Q969G3 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms