Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GTF3C6Q969F1 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GTF3C6Q969F1 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GTF3C6Q969F1 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GTF3C6Q969F1 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GTF3C6Q969F1 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GTF3C6Q969F1 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GTF3C6Q969F1 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GTF3C6Q969F1 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
GTF3C6Q969F1 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GTF3C6Q969F1 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
GTF3C6Q969F1 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GTF3C6Q969F1 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GTF3C6Q969F1 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GTF3C6Q969F1 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GTF3C6Q969F1 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GTF3C6Q969F1 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GTF3C6Q969F1 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF3C6Q969F1 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF3C6Q969F1 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF3C6Q969F1 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF3C6Q969F1 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF3C6Q969F1 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF3C6Q969F1 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF3C6Q969F1 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF3C6Q969F1 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF3C6Q969F1 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF3C6Q969F1 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF3C6Q969F1 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF3C6Q969F1 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF3C6Q969F1 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF3C6Q969F1 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF3C6Q969F1 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF3C6Q969F1 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF3C6Q969F1 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF3C6Q969F1 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF3C6Q969F1 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF3C6Q969F1 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF3C6Q969F1 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF3C6Q969F1 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF3C6Q969F1 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF3C6Q969F1 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF3C6Q969F1 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF3C6Q969F1 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF3C6Q969F1 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF3C6Q969F1 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
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GTF3C6Q969F1 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GTF3C6Q969F1 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GTF3C6Q969F1 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GTF3C6Q969F1 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
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GTF3C6Q969F1 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
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GTF3C6Q969F1 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GTF3C6Q969F1 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GTF3C6Q969F1 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GTF3C6Q969F1 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GTF3C6Q969F1 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GTF3C6Q969F1 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GTF3C6Q969F1 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GTF3C6Q969F1 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GTF3C6Q969F1 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GTF3C6Q969F1 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GTF3C6Q969F1 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GTF3C6Q969F1 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GTF3C6Q969F1 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GTF3C6Q969F1 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GTF3C6Q969F1 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GTF3C6Q969F1 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GTF3C6Q969F1 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
GTF3C6Q969F1 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GTF3C6Q969F1 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GTF3C6Q969F1 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GTF3C6Q969F1 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GTF3C6Q969F1 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
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