Protein–RNA interactions for Protein: Q92764

KRT35, Keratin, type I cuticular Ha5, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT35Q92764 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KRT35Q92764 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KRT35Q92764 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KRT35Q92764 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KRT35Q92764 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KRT35Q92764 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KRT35Q92764 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KRT35Q92764 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KRT35Q92764 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KRT35Q92764 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KRT35Q92764 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KRT35Q92764 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
KRT35Q92764 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KRT35Q92764 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KRT35Q92764 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KRT35Q92764 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KRT35Q92764 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
KRT35Q92764 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KRT35Q92764 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KRT35Q92764 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KRT35Q92764 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KRT35Q92764 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KRT35Q92764 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KRT35Q92764 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
KRT35Q92764 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KRT35Q92764 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
KRT35Q92764 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KRT35Q92764 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KRT35Q92764 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
KRT35Q92764 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KRT35Q92764 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KRT35Q92764 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KRT35Q92764 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KRT35Q92764 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KRT35Q92764 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KRT35Q92764 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KRT35Q92764 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KRT35Q92764 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KRT35Q92764 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KRT35Q92764 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KRT35Q92764 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KRT35Q92764 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KRT35Q92764 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KRT35Q92764 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KRT35Q92764 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KRT35Q92764 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KRT35Q92764 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KRT35Q92764 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KRT35Q92764 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KRT35Q92764 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KRT35Q92764 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KRT35Q92764 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KRT35Q92764 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KRT35Q92764 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KRT35Q92764 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KRT35Q92764 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KRT35Q92764 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KRT35Q92764 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KRT35Q92764 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KRT35Q92764 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KRT35Q92764 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KRT35Q92764 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KRT35Q92764 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KRT35Q92764 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KRT35Q92764 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KRT35Q92764 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KRT35Q92764 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KRT35Q92764 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KRT35Q92764 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
KRT35Q92764 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KRT35Q92764 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KRT35Q92764 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KRT35Q92764 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KRT35Q92764 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KRT35Q92764 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KRT35Q92764 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KRT35Q92764 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
KRT35Q92764 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
KRT35Q92764 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
KRT35Q92764 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KRT35Q92764 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KRT35Q92764 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
KRT35Q92764 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KRT35Q92764 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KRT35Q92764 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KRT35Q92764 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KRT35Q92764 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
KRT35Q92764 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT35Q92764 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT35Q92764 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT35Q92764 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT35Q92764 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT35Q92764 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT35Q92764 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT35Q92764 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT35Q92764 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT35Q92764 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT35Q92764 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT35Q92764 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT35Q92764 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66 ms