Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBB5

KLHDC4, Kelch domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC4Q8TBB5 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHDC4Q8TBB5 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHDC4Q8TBB5 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHDC4Q8TBB5 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHDC4Q8TBB5 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHDC4Q8TBB5 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHDC4Q8TBB5 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHDC4Q8TBB5 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHDC4Q8TBB5 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHDC4Q8TBB5 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHDC4Q8TBB5 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHDC4Q8TBB5 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHDC4Q8TBB5 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHDC4Q8TBB5 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHDC4Q8TBB5 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHDC4Q8TBB5 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHDC4Q8TBB5 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHDC4Q8TBB5 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHDC4Q8TBB5 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHDC4Q8TBB5 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHDC4Q8TBB5 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHDC4Q8TBB5 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHDC4Q8TBB5 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHDC4Q8TBB5 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHDC4Q8TBB5 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHDC4Q8TBB5 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHDC4Q8TBB5 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHDC4Q8TBB5 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHDC4Q8TBB5 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHDC4Q8TBB5 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHDC4Q8TBB5 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHDC4Q8TBB5 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHDC4Q8TBB5 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHDC4Q8TBB5 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHDC4Q8TBB5 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHDC4Q8TBB5 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHDC4Q8TBB5 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHDC4Q8TBB5 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHDC4Q8TBB5 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHDC4Q8TBB5 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHDC4Q8TBB5 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHDC4Q8TBB5 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHDC4Q8TBB5 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHDC4Q8TBB5 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHDC4Q8TBB5 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHDC4Q8TBB5 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHDC4Q8TBB5 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
KLHDC4Q8TBB5 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHDC4Q8TBB5 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHDC4Q8TBB5 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHDC4Q8TBB5 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHDC4Q8TBB5 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHDC4Q8TBB5 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHDC4Q8TBB5 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHDC4Q8TBB5 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHDC4Q8TBB5 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHDC4Q8TBB5 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHDC4Q8TBB5 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHDC4Q8TBB5 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHDC4Q8TBB5 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHDC4Q8TBB5 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHDC4Q8TBB5 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHDC4Q8TBB5 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHDC4Q8TBB5 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHDC4Q8TBB5 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHDC4Q8TBB5 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHDC4Q8TBB5 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHDC4Q8TBB5 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHDC4Q8TBB5 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHDC4Q8TBB5 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHDC4Q8TBB5 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHDC4Q8TBB5 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHDC4Q8TBB5 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHDC4Q8TBB5 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHDC4Q8TBB5 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHDC4Q8TBB5 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHDC4Q8TBB5 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHDC4Q8TBB5 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHDC4Q8TBB5 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHDC4Q8TBB5 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHDC4Q8TBB5 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHDC4Q8TBB5 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHDC4Q8TBB5 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHDC4Q8TBB5 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHDC4Q8TBB5 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHDC4Q8TBB5 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHDC4Q8TBB5 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHDC4Q8TBB5 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHDC4Q8TBB5 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHDC4Q8TBB5 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHDC4Q8TBB5 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHDC4Q8TBB5 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHDC4Q8TBB5 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHDC4Q8TBB5 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHDC4Q8TBB5 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHDC4Q8TBB5 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHDC4Q8TBB5 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHDC4Q8TBB5 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHDC4Q8TBB5 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHDC4Q8TBB5 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms