Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9W8

FAM71D, Protein FAM71D, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71DQ8N9W8 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
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FAM71DQ8N9W8 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM71DQ8N9W8 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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FAM71DQ8N9W8 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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FAM71DQ8N9W8 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM71DQ8N9W8 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM71DQ8N9W8 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM71DQ8N9W8 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM71DQ8N9W8 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM71DQ8N9W8 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM71DQ8N9W8 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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