Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F7

GCSAM, Germinal center-associated signaling and motility protein, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSAMQ8N6F7 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
GCSAMQ8N6F7 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
GCSAMQ8N6F7 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
GCSAMQ8N6F7 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
GCSAMQ8N6F7 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
GCSAMQ8N6F7 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
GCSAMQ8N6F7 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
GCSAMQ8N6F7 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
GCSAMQ8N6F7 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
GCSAMQ8N6F7 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
GCSAMQ8N6F7 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
GCSAMQ8N6F7 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
GCSAMQ8N6F7 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
GCSAMQ8N6F7 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
GCSAMQ8N6F7 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
GCSAMQ8N6F7 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
GCSAMQ8N6F7 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
GCSAMQ8N6F7 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
GCSAMQ8N6F7 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
GCSAMQ8N6F7 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
GCSAMQ8N6F7 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
GCSAMQ8N6F7 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
GCSAMQ8N6F7 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
GCSAMQ8N6F7 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC12.7□□□□□ -0.38
GCSAMQ8N6F7 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC12.7□□□□□ -0.38
GCSAMQ8N6F7 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
GCSAMQ8N6F7 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
GCSAMQ8N6F7 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
GCSAMQ8N6F7 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
GCSAMQ8N6F7 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
GCSAMQ8N6F7 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
GCSAMQ8N6F7 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
GCSAMQ8N6F7 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
GCSAMQ8N6F7 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
GCSAMQ8N6F7 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
GCSAMQ8N6F7 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
GCSAMQ8N6F7 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
GCSAMQ8N6F7 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
GCSAMQ8N6F7 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
GCSAMQ8N6F7 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
GCSAMQ8N6F7 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
GCSAMQ8N6F7 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
GCSAMQ8N6F7 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
GCSAMQ8N6F7 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
GCSAMQ8N6F7 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
GCSAMQ8N6F7 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
GCSAMQ8N6F7 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
GCSAMQ8N6F7 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
GCSAMQ8N6F7 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
GCSAMQ8N6F7 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
GCSAMQ8N6F7 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
GCSAMQ8N6F7 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
GCSAMQ8N6F7 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
GCSAMQ8N6F7 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
GCSAMQ8N6F7 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
GCSAMQ8N6F7 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
GCSAMQ8N6F7 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
GCSAMQ8N6F7 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
GCSAMQ8N6F7 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
GCSAMQ8N6F7 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
GCSAMQ8N6F7 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
GCSAMQ8N6F7 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
GCSAMQ8N6F7 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
GCSAMQ8N6F7 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
GCSAMQ8N6F7 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
GCSAMQ8N6F7 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
GCSAMQ8N6F7 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
GCSAMQ8N6F7 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
GCSAMQ8N6F7 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
GCSAMQ8N6F7 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
GCSAMQ8N6F7 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
GCSAMQ8N6F7 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
GCSAMQ8N6F7 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
GCSAMQ8N6F7 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
GCSAMQ8N6F7 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
GCSAMQ8N6F7 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
GCSAMQ8N6F7 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
GCSAMQ8N6F7 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
GCSAMQ8N6F7 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
GCSAMQ8N6F7 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
GCSAMQ8N6F7 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
GCSAMQ8N6F7 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
GCSAMQ8N6F7 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
GCSAMQ8N6F7 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
GCSAMQ8N6F7 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
GCSAMQ8N6F7 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
GCSAMQ8N6F7 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
GCSAMQ8N6F7 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
GCSAMQ8N6F7 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
GCSAMQ8N6F7 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
GCSAMQ8N6F7 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
GCSAMQ8N6F7 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
GCSAMQ8N6F7 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
GCSAMQ8N6F7 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
GCSAMQ8N6F7 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
GCSAMQ8N6F7 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
GCSAMQ8N6F7 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
GCSAMQ8N6F7 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
GCSAMQ8N6F7 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
GCSAMQ8N6F7 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.2 ms