Protein–RNA interactions for Protein: Q8N205

SYNE4, Nesprin-4, humanhuman

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Length 404 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4Q8N205 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYNE4Q8N205 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYNE4Q8N205 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYNE4Q8N205 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SYNE4Q8N205 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SYNE4Q8N205 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SYNE4Q8N205 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYNE4Q8N205 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYNE4Q8N205 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYNE4Q8N205 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYNE4Q8N205 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SYNE4Q8N205 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYNE4Q8N205 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYNE4Q8N205 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYNE4Q8N205 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYNE4Q8N205 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYNE4Q8N205 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYNE4Q8N205 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SYNE4Q8N205 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYNE4Q8N205 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYNE4Q8N205 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYNE4Q8N205 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYNE4Q8N205 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SYNE4Q8N205 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SYNE4Q8N205 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SYNE4Q8N205 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SYNE4Q8N205 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SYNE4Q8N205 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SYNE4Q8N205 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SYNE4Q8N205 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SYNE4Q8N205 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SYNE4Q8N205 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SYNE4Q8N205 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SYNE4Q8N205 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SYNE4Q8N205 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SYNE4Q8N205 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SYNE4Q8N205 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SYNE4Q8N205 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SYNE4Q8N205 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SYNE4Q8N205 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SYNE4Q8N205 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SYNE4Q8N205 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SYNE4Q8N205 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SYNE4Q8N205 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SYNE4Q8N205 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SYNE4Q8N205 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SYNE4Q8N205 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SYNE4Q8N205 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SYNE4Q8N205 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SYNE4Q8N205 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SYNE4Q8N205 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SYNE4Q8N205 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SYNE4Q8N205 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SYNE4Q8N205 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SYNE4Q8N205 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SYNE4Q8N205 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SYNE4Q8N205 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SYNE4Q8N205 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SYNE4Q8N205 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SYNE4Q8N205 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SYNE4Q8N205 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SYNE4Q8N205 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SYNE4Q8N205 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SYNE4Q8N205 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SYNE4Q8N205 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SYNE4Q8N205 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SYNE4Q8N205 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SYNE4Q8N205 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SYNE4Q8N205 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SYNE4Q8N205 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SYNE4Q8N205 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SYNE4Q8N205 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SYNE4Q8N205 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SYNE4Q8N205 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SYNE4Q8N205 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SYNE4Q8N205 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SYNE4Q8N205 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SYNE4Q8N205 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SYNE4Q8N205 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SYNE4Q8N205 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SYNE4Q8N205 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SYNE4Q8N205 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SYNE4Q8N205 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SYNE4Q8N205 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SYNE4Q8N205 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SYNE4Q8N205 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SYNE4Q8N205 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SYNE4Q8N205 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SYNE4Q8N205 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYNE4Q8N205 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYNE4Q8N205 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYNE4Q8N205 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYNE4Q8N205 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYNE4Q8N205 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYNE4Q8N205 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYNE4Q8N205 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYNE4Q8N205 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SYNE4Q8N205 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYNE4Q8N205 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYNE4Q8N205 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
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