Protein–RNA interactions for Protein: Q658K8

EEF1DP3, Putative elongation factor 1-delta-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEF1DP3Q658K8 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EEF1DP3Q658K8 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
EEF1DP3Q658K8 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EEF1DP3Q658K8 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EEF1DP3Q658K8 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EEF1DP3Q658K8 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EEF1DP3Q658K8 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EEF1DP3Q658K8 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EEF1DP3Q658K8 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
EEF1DP3Q658K8 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
EEF1DP3Q658K8 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
EEF1DP3Q658K8 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EEF1DP3Q658K8 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EEF1DP3Q658K8 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EEF1DP3Q658K8 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EEF1DP3Q658K8 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EEF1DP3Q658K8 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EEF1DP3Q658K8 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EEF1DP3Q658K8 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EEF1DP3Q658K8 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EEF1DP3Q658K8 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EEF1DP3Q658K8 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EEF1DP3Q658K8 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EEF1DP3Q658K8 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EEF1DP3Q658K8 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EEF1DP3Q658K8 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EEF1DP3Q658K8 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EEF1DP3Q658K8 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EEF1DP3Q658K8 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EEF1DP3Q658K8 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EEF1DP3Q658K8 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EEF1DP3Q658K8 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EEF1DP3Q658K8 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EEF1DP3Q658K8 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EEF1DP3Q658K8 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EEF1DP3Q658K8 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EEF1DP3Q658K8 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EEF1DP3Q658K8 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EEF1DP3Q658K8 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EEF1DP3Q658K8 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EEF1DP3Q658K8 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
EEF1DP3Q658K8 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EEF1DP3Q658K8 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EEF1DP3Q658K8 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EEF1DP3Q658K8 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EEF1DP3Q658K8 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EEF1DP3Q658K8 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EEF1DP3Q658K8 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EEF1DP3Q658K8 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EEF1DP3Q658K8 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EEF1DP3Q658K8 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EEF1DP3Q658K8 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
EEF1DP3Q658K8 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EEF1DP3Q658K8 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EEF1DP3Q658K8 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
EEF1DP3Q658K8 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EEF1DP3Q658K8 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EEF1DP3Q658K8 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EEF1DP3Q658K8 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EEF1DP3Q658K8 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EEF1DP3Q658K8 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EEF1DP3Q658K8 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EEF1DP3Q658K8 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EEF1DP3Q658K8 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EEF1DP3Q658K8 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EEF1DP3Q658K8 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EEF1DP3Q658K8 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EEF1DP3Q658K8 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
EEF1DP3Q658K8 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
EEF1DP3Q658K8 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
EEF1DP3Q658K8 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EEF1DP3Q658K8 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EEF1DP3Q658K8 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EEF1DP3Q658K8 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EEF1DP3Q658K8 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EEF1DP3Q658K8 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EEF1DP3Q658K8 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EEF1DP3Q658K8 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EEF1DP3Q658K8 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EEF1DP3Q658K8 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EEF1DP3Q658K8 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EEF1DP3Q658K8 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EEF1DP3Q658K8 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EEF1DP3Q658K8 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EEF1DP3Q658K8 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EEF1DP3Q658K8 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
EEF1DP3Q658K8 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EEF1DP3Q658K8 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EEF1DP3Q658K8 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EEF1DP3Q658K8 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EEF1DP3Q658K8 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EEF1DP3Q658K8 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EEF1DP3Q658K8 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EEF1DP3Q658K8 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EEF1DP3Q658K8 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EEF1DP3Q658K8 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
EEF1DP3Q658K8 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
EEF1DP3Q658K8 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EEF1DP3Q658K8 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EEF1DP3Q658K8 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms