Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTR2

RNF20, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1A, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF20Q5VTR2 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RNF20Q5VTR2 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RNF20Q5VTR2 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RNF20Q5VTR2 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RNF20Q5VTR2 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RNF20Q5VTR2 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RNF20Q5VTR2 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RNF20Q5VTR2 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RNF20Q5VTR2 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RNF20Q5VTR2 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RNF20Q5VTR2 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RNF20Q5VTR2 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RNF20Q5VTR2 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RNF20Q5VTR2 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RNF20Q5VTR2 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RNF20Q5VTR2 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RNF20Q5VTR2 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RNF20Q5VTR2 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RNF20Q5VTR2 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RNF20Q5VTR2 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RNF20Q5VTR2 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RNF20Q5VTR2 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RNF20Q5VTR2 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RNF20Q5VTR2 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RNF20Q5VTR2 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RNF20Q5VTR2 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RNF20Q5VTR2 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RNF20Q5VTR2 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RNF20Q5VTR2 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RNF20Q5VTR2 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RNF20Q5VTR2 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RNF20Q5VTR2 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RNF20Q5VTR2 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RNF20Q5VTR2 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RNF20Q5VTR2 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RNF20Q5VTR2 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RNF20Q5VTR2 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RNF20Q5VTR2 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RNF20Q5VTR2 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RNF20Q5VTR2 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RNF20Q5VTR2 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RNF20Q5VTR2 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RNF20Q5VTR2 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RNF20Q5VTR2 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RNF20Q5VTR2 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RNF20Q5VTR2 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RNF20Q5VTR2 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RNF20Q5VTR2 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RNF20Q5VTR2 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RNF20Q5VTR2 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RNF20Q5VTR2 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RNF20Q5VTR2 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RNF20Q5VTR2 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RNF20Q5VTR2 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RNF20Q5VTR2 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RNF20Q5VTR2 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RNF20Q5VTR2 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RNF20Q5VTR2 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RNF20Q5VTR2 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RNF20Q5VTR2 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RNF20Q5VTR2 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RNF20Q5VTR2 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RNF20Q5VTR2 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RNF20Q5VTR2 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RNF20Q5VTR2 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RNF20Q5VTR2 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RNF20Q5VTR2 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RNF20Q5VTR2 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RNF20Q5VTR2 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RNF20Q5VTR2 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
RNF20Q5VTR2 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RNF20Q5VTR2 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RNF20Q5VTR2 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RNF20Q5VTR2 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RNF20Q5VTR2 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
RNF20Q5VTR2 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RNF20Q5VTR2 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RNF20Q5VTR2 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RNF20Q5VTR2 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RNF20Q5VTR2 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RNF20Q5VTR2 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RNF20Q5VTR2 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RNF20Q5VTR2 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RNF20Q5VTR2 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RNF20Q5VTR2 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RNF20Q5VTR2 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RNF20Q5VTR2 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RNF20Q5VTR2 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RNF20Q5VTR2 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
RNF20Q5VTR2 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RNF20Q5VTR2 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RNF20Q5VTR2 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RNF20Q5VTR2 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RNF20Q5VTR2 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RNF20Q5VTR2 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RNF20Q5VTR2 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RNF20Q5VTR2 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RNF20Q5VTR2 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RNF20Q5VTR2 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RNF20Q5VTR2 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms