Protein–RNA interactions for Protein: Q5FBB7

SGO1, Shugoshin 1, humanhuman

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Length 561 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGO1Q5FBB7 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SGO1Q5FBB7 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SGO1Q5FBB7 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SGO1Q5FBB7 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SGO1Q5FBB7 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SGO1Q5FBB7 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SGO1Q5FBB7 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SGO1Q5FBB7 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SGO1Q5FBB7 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SGO1Q5FBB7 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SGO1Q5FBB7 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SGO1Q5FBB7 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SGO1Q5FBB7 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SGO1Q5FBB7 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SGO1Q5FBB7 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SGO1Q5FBB7 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SGO1Q5FBB7 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SGO1Q5FBB7 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SGO1Q5FBB7 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SGO1Q5FBB7 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SGO1Q5FBB7 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SGO1Q5FBB7 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SGO1Q5FBB7 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SGO1Q5FBB7 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SGO1Q5FBB7 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SGO1Q5FBB7 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SGO1Q5FBB7 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SGO1Q5FBB7 COL22A1-201ENST00000303045 6346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SGO1Q5FBB7 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
SGO1Q5FBB7 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
SGO1Q5FBB7 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
SGO1Q5FBB7 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SGO1Q5FBB7 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SGO1Q5FBB7 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SGO1Q5FBB7 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SGO1Q5FBB7 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SGO1Q5FBB7 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SGO1Q5FBB7 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SGO1Q5FBB7 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SGO1Q5FBB7 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SGO1Q5FBB7 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SGO1Q5FBB7 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SGO1Q5FBB7 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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SGO1Q5FBB7 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SGO1Q5FBB7 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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SGO1Q5FBB7 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SGO1Q5FBB7 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SGO1Q5FBB7 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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SGO1Q5FBB7 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SGO1Q5FBB7 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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SGO1Q5FBB7 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SGO1Q5FBB7 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SGO1Q5FBB7 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SGO1Q5FBB7 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SGO1Q5FBB7 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SGO1Q5FBB7 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SGO1Q5FBB7 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SGO1Q5FBB7 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SGO1Q5FBB7 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SGO1Q5FBB7 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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