Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 LINC00384-201ENST00000437721 6852 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 TUBGCP6-201ENST00000248846 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 SPTBN2-204ENST00000529997 8085 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 FLT4-201ENST00000261937 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 UBE3A-228ENST00000638155 9131 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 GRM1-204ENST00000492807 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 PRDM16-201ENST00000270722 8690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 DGKE-201ENST00000284061 8660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 PER3-201ENST00000361923 6203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 ISY1-RAB43-201ENST00000418265 4868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 GUF1-201ENST00000281543 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 WNT5A-202ENST00000474267 6042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 MGLL-201ENST00000265052 4642 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 GAS6-AS1-201ENST00000458001 7169 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 BORCS5-202ENST00000314565 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 TRAF3-208ENST00000560371 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 TONSL-201ENST00000409379 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 TNNI1-207ENST00000622580 6142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 UBE3A-226ENST00000637886 8725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 DDX3X-201ENST00000399959 5399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
ODF2Q5BJF6 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 MYLK-202ENST00000354792 7531 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 SON-203ENST00000381679 7860 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.4 ms