Protein–RNA interactions for Protein: Q2VPB7

AP5B1, AP-5 complex subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 878 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP5B1Q2VPB7 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
AP5B1Q2VPB7 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
AP5B1Q2VPB7 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
AP5B1Q2VPB7 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
AP5B1Q2VPB7 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
AP5B1Q2VPB7 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
AP5B1Q2VPB7 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
AP5B1Q2VPB7 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
AP5B1Q2VPB7 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
AP5B1Q2VPB7 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
AP5B1Q2VPB7 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
AP5B1Q2VPB7 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
AP5B1Q2VPB7 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
AP5B1Q2VPB7 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
AP5B1Q2VPB7 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
AP5B1Q2VPB7 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
AP5B1Q2VPB7 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
AP5B1Q2VPB7 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
AP5B1Q2VPB7 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
AP5B1Q2VPB7 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
AP5B1Q2VPB7 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
AP5B1Q2VPB7 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
AP5B1Q2VPB7 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
AP5B1Q2VPB7 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
AP5B1Q2VPB7 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
AP5B1Q2VPB7 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
AP5B1Q2VPB7 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
AP5B1Q2VPB7 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
AP5B1Q2VPB7 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
AP5B1Q2VPB7 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
AP5B1Q2VPB7 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
AP5B1Q2VPB7 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
AP5B1Q2VPB7 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
AP5B1Q2VPB7 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
AP5B1Q2VPB7 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
AP5B1Q2VPB7 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
AP5B1Q2VPB7 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
AP5B1Q2VPB7 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
AP5B1Q2VPB7 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
AP5B1Q2VPB7 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
AP5B1Q2VPB7 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
AP5B1Q2VPB7 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
AP5B1Q2VPB7 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
AP5B1Q2VPB7 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
AP5B1Q2VPB7 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
AP5B1Q2VPB7 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
AP5B1Q2VPB7 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
AP5B1Q2VPB7 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
AP5B1Q2VPB7 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
AP5B1Q2VPB7 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
AP5B1Q2VPB7 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
AP5B1Q2VPB7 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
AP5B1Q2VPB7 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
AP5B1Q2VPB7 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
AP5B1Q2VPB7 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
AP5B1Q2VPB7 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
AP5B1Q2VPB7 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
AP5B1Q2VPB7 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
AP5B1Q2VPB7 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
AP5B1Q2VPB7 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
AP5B1Q2VPB7 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
AP5B1Q2VPB7 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
AP5B1Q2VPB7 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
AP5B1Q2VPB7 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
AP5B1Q2VPB7 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
AP5B1Q2VPB7 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
AP5B1Q2VPB7 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
AP5B1Q2VPB7 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
AP5B1Q2VPB7 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
AP5B1Q2VPB7 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
AP5B1Q2VPB7 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
AP5B1Q2VPB7 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
AP5B1Q2VPB7 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
AP5B1Q2VPB7 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
AP5B1Q2VPB7 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
AP5B1Q2VPB7 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
AP5B1Q2VPB7 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
AP5B1Q2VPB7 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
AP5B1Q2VPB7 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
AP5B1Q2VPB7 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
AP5B1Q2VPB7 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
AP5B1Q2VPB7 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
AP5B1Q2VPB7 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
AP5B1Q2VPB7 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
AP5B1Q2VPB7 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
AP5B1Q2VPB7 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
AP5B1Q2VPB7 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
AP5B1Q2VPB7 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
AP5B1Q2VPB7 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
AP5B1Q2VPB7 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
AP5B1Q2VPB7 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
AP5B1Q2VPB7 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.07
AP5B1Q2VPB7 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AP5B1Q2VPB7 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AP5B1Q2VPB7 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AP5B1Q2VPB7 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
AP5B1Q2VPB7 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
AP5B1Q2VPB7 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AP5B1Q2VPB7 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
AP5B1Q2VPB7 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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