Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBA0

KLHL40, Kelch-like protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL40Q2TBA0 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL40Q2TBA0 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL40Q2TBA0 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL40Q2TBA0 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL40Q2TBA0 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL40Q2TBA0 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL40Q2TBA0 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL40Q2TBA0 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL40Q2TBA0 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL40Q2TBA0 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL40Q2TBA0 AGAP5-201ENST00000374094 2394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL40Q2TBA0 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL40Q2TBA0 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL40Q2TBA0 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL40Q2TBA0 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL40Q2TBA0 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL40Q2TBA0 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL40Q2TBA0 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL40Q2TBA0 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL40Q2TBA0 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL40Q2TBA0 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL40Q2TBA0 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL40Q2TBA0 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL40Q2TBA0 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL40Q2TBA0 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL40Q2TBA0 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL40Q2TBA0 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL40Q2TBA0 SLC22A20-202ENST00000525437 3196 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL40Q2TBA0 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL40Q2TBA0 ABCC6P1-201ENST00000546162 2943 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL40Q2TBA0 EGR1-201ENST00000239938 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL40Q2TBA0 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL40Q2TBA0 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL40Q2TBA0 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL40Q2TBA0 PSME3-203ENST00000541124 3366 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL40Q2TBA0 VIPR1-202ENST00000433647 3161 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL40Q2TBA0 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLHL40Q2TBA0 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLHL40Q2TBA0 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLHL40Q2TBA0 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLHL40Q2TBA0 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLHL40Q2TBA0 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLHL40Q2TBA0 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLHL40Q2TBA0 ACADM-202ENST00000370841 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLHL40Q2TBA0 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLHL40Q2TBA0 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLHL40Q2TBA0 VPS9D1-202ENST00000561976 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLHL40Q2TBA0 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLHL40Q2TBA0 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLHL40Q2TBA0 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLHL40Q2TBA0 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLHL40Q2TBA0 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLHL40Q2TBA0 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLHL40Q2TBA0 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLHL40Q2TBA0 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
KLHL40Q2TBA0 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLHL40Q2TBA0 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLHL40Q2TBA0 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLHL40Q2TBA0 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLHL40Q2TBA0 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLHL40Q2TBA0 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
KLHL40Q2TBA0 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLHL40Q2TBA0 ZDHHC6-202ENST00000369405 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLHL40Q2TBA0 GOSR2-235ENST00000640269 2190 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLHL40Q2TBA0 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLHL40Q2TBA0 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLHL40Q2TBA0 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLHL40Q2TBA0 NUP98-204ENST00000397004 3923 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 AC012349.1-201ENST00000518662 2643 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 SCNN1A-215ENST00000540037 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 GAP43-202ENST00000393780 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 TMEM63B-202ENST00000323267 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 Z82170.1-201ENST00000625081 3192 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 PVR-205ENST00000425690 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms