Protein–RNA interactions for Protein: Q2M238

RRN3P1, Putative RRN3-like protein RRN3P1, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3P1Q2M238 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 ABI2-201ENST00000261016 6634 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 ABI2-203ENST00000261018 6638 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 PRDM10-202ENST00000358825 6322 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 PRDM10-203ENST00000360871 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 ALDH7A1-201ENST00000409134 4964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 TIAM1-201ENST00000286827 7200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 AL731571.1-201ENST00000617058 5428 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 CSPG4P11-201ENST00000560634 4910 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 DISC1-206ENST00000366637 6848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 LDB3-202ENST00000361373 5297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 ARHGAP35-206ENST00000614079 7696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 IKZF1-203ENST00000346667 5376 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 BORCS5-202ENST00000314565 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms