Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPROQ16827 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPROQ16827 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPROQ16827 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPROQ16827 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPROQ16827 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPROQ16827 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPROQ16827 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPROQ16827 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPROQ16827 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPROQ16827 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPROQ16827 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPROQ16827 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPROQ16827 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPROQ16827 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPROQ16827 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPROQ16827 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPROQ16827 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPROQ16827 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
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PTPROQ16827 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPROQ16827 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPROQ16827 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPROQ16827 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPROQ16827 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPROQ16827 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPROQ16827 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPROQ16827 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPROQ16827 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPROQ16827 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPROQ16827 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPROQ16827 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPROQ16827 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPROQ16827 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPROQ16827 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPROQ16827 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPROQ16827 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPROQ16827 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPROQ16827 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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PTPROQ16827 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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PTPROQ16827 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPROQ16827 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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PTPROQ16827 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPROQ16827 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPROQ16827 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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PTPROQ16827 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
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PTPROQ16827 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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PTPROQ16827 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPROQ16827 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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PTPROQ16827 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
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PTPROQ16827 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPROQ16827 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPROQ16827 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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PTPROQ16827 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPROQ16827 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPROQ16827 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPROQ16827 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPROQ16827 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPROQ16827 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPROQ16827 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPROQ16827 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPROQ16827 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPROQ16827 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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PTPROQ16827 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPROQ16827 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPROQ16827 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPROQ16827 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPROQ16827 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPROQ16827 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPROQ16827 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPROQ16827 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPROQ16827 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPROQ16827 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPROQ16827 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPROQ16827 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPROQ16827 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPROQ16827 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPROQ16827 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPROQ16827 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPROQ16827 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPROQ16827 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPROQ16827 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPROQ16827 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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