Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
ZFHX3Q15911 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
ZFHX3Q15911 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
ZFHX3Q15911 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
ZFHX3Q15911 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
ZFHX3Q15911 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
ZFHX3Q15911 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
ZFHX3Q15911 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
ZFHX3Q15911 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
ZFHX3Q15911 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
ZFHX3Q15911 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
ZFHX3Q15911 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
ZFHX3Q15911 CSHL1-201ENST00000259003 739 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
ZFHX3Q15911 IGLC1-201ENST00000390321 460 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
ZFHX3Q15911 AL121983.2-202ENST00000419983 535 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
ZFHX3Q15911 CSHL1-206ENST00000450719 973 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
ZFHX3Q15911 CISD2-202ENST00000503643 808 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
ZFHX3Q15911 TCL1A-205ENST00000555202 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
ZFHX3Q15911 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
ZFHX3Q15911 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
ZFHX3Q15911 ADSL-201ENST00000216194 1620 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
ZFHX3Q15911 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
ZFHX3Q15911 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
ZFHX3Q15911 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
ZFHX3Q15911 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
ZFHX3Q15911 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
ZFHX3Q15911 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
ZFHX3Q15911 MRPS11-202ENST00000353598 766 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
ZFHX3Q15911 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
ZFHX3Q15911 HLA-DMA-203ENST00000395305 777 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
ZFHX3Q15911 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
ZFHX3Q15911 LINC00313-207ENST00000451543 413 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
ZFHX3Q15911 IKBKB-223ENST00000522147 954 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
ZFHX3Q15911 AAMDC-210ENST00000532481 690 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
ZFHX3Q15911 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
ZFHX3Q15911 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
ZFHX3Q15911 UBA52-214ENST00000599595 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
ZFHX3Q15911 RNF103-CHMP3-202ENST00000604011 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
ZFHX3Q15911 LINC01669-201ENST00000623161 413 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
ZFHX3Q15911 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
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ZFHX3Q15911 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
ZFHX3Q15911 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
ZFHX3Q15911 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 ANKRD2-204ENST00000455090 1072 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 TGFBI-207ENST00000508076 1034 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 AC005759.1-202ENST00000599416 415 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
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ZFHX3Q15911 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 SPAAR-203ENST00000636776 1538 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 C7orf61-201ENST00000332375 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 AC098657.1-201ENST00000416270 1135 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
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ZFHX3Q15911 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
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ZFHX3Q15911 LINC02171-201ENST00000508619 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
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ZFHX3Q15911 AC009163.5-202ENST00000571737 466 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 KLKP1-202ENST00000597246 1125 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 SLC12A5-219ENST00000628272 401 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 KCTD6-202ENST00000404589 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 ATP5J-204ENST00000400093 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 AC103923.1-201ENST00000453229 1228 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 AC022121.1-201ENST00000484584 579 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 AC093627.2-201ENST00000497017 568 ntTSL 4 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 INO80E-209ENST00000567254 625 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
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