Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
NEDD8Q15843 GTF2IRD2-201ENST00000451013 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
NEDD8Q15843 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
NEDD8Q15843 POLM-201ENST00000242248 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
NEDD8Q15843 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
NEDD8Q15843 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
NEDD8Q15843 DLGAP1-205ENST00000400150 5332 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
NEDD8Q15843 TMC8-201ENST00000318430 4411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
NEDD8Q15843 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
NEDD8Q15843 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
NEDD8Q15843 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
NEDD8Q15843 LRSAM1-201ENST00000300417 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
NEDD8Q15843 PGAM1P5-202ENST00000552554 2148 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
NEDD8Q15843 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
NEDD8Q15843 PTK7-205ENST00000352931 4023 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
NEDD8Q15843 MAGED4B-201ENST00000335504 2578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
NEDD8Q15843 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
NEDD8Q15843 BEND7-201ENST00000341083 2239 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
NEDD8Q15843 C6orf62-202ENST00000378119 4134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
NEDD8Q15843 ENG-202ENST00000373203 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
NEDD8Q15843 ARAP1-201ENST00000334211 4942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
NEDD8Q15843 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
NEDD8Q15843 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
NEDD8Q15843 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
NEDD8Q15843 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
NEDD8Q15843 WAPL-201ENST00000263070 5987 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
NEDD8Q15843 AMER2-201ENST00000357816 10055 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
NEDD8Q15843 FOXP3-204ENST00000455775 2448 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
NEDD8Q15843 PP14571-202ENST00000404891 2017 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
NEDD8Q15843 BTRC-202ENST00000370187 6134 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
NEDD8Q15843 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
NEDD8Q15843 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
NEDD8Q15843 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
NEDD8Q15843 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
NEDD8Q15843 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
NEDD8Q15843 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
NEDD8Q15843 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
NEDD8Q15843 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC13.8□□□□□ -0.2
NEDD8Q15843 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
NEDD8Q15843 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
NEDD8Q15843 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
NEDD8Q15843 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
NEDD8Q15843 RRM2B-211ENST00000621845 3483 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
NEDD8Q15843 LINC01341-202ENST00000421003 2600 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
NEDD8Q15843 HECTD2-201ENST00000298068 4802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
NEDD8Q15843 TRDMT1-203ENST00000377799 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
NEDD8Q15843 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
NEDD8Q15843 LYN-204ENST00000520220 5808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
NEDD8Q15843 NUTM2E-202ENST00000602967 3623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
NEDD8Q15843 EPRS-201ENST00000366923 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
NEDD8Q15843 CYP26B1-201ENST00000001146 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
NEDD8Q15843 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
NEDD8Q15843 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
NEDD8Q15843 MLPH-201ENST00000264605 3823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
NEDD8Q15843 ACAP2-201ENST00000326793 7160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
NEDD8Q15843 TRIM11-204ENST00000493030 5774 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
NEDD8Q15843 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
NEDD8Q15843 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
NEDD8Q15843 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
NEDD8Q15843 AL139193.2-201ENST00000553712 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
NEDD8Q15843 BRSK1-206ENST00000590333 2977 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
NEDD8Q15843 RBSN-207ENST00000476527 3005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
NEDD8Q15843 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
NEDD8Q15843 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
NEDD8Q15843 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
NEDD8Q15843 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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NEDD8Q15843 RIPK4-201ENST00000332512 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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NEDD8Q15843 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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NEDD8Q15843 SLC5A5-201ENST00000222248 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
NEDD8Q15843 SLC9A8-201ENST00000361573 6094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
NEDD8Q15843 COL2A1-201ENST00000337299 4257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
NEDD8Q15843 GPRC5A-201ENST00000014914 7362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
NEDD8Q15843 AMOTL2-202ENST00000422605 4335 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
NEDD8Q15843 C15orf39-202ENST00000394987 4430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
NEDD8Q15843 DUOX2-205ENST00000603300 6345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
NEDD8Q15843 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
NEDD8Q15843 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
NEDD8Q15843 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
NEDD8Q15843 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
NEDD8Q15843 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
NEDD8Q15843 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
NEDD8Q15843 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
NEDD8Q15843 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
NEDD8Q15843 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
NEDD8Q15843 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
NEDD8Q15843 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
NEDD8Q15843 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
NEDD8Q15843 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
NEDD8Q15843 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
NEDD8Q15843 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
NEDD8Q15843 CACNA1G-203ENST00000358244 7030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
NEDD8Q15843 INMT-201ENST00000013222 2559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
NEDD8Q15843 SPATA20-227ENST00000634597 2587 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
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