Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 ATG5-202ENST00000360666 2712 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 ENOSF1-203ENST00000383578 4188 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 BX255923.2-202ENST00000620833 2874 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 KDM7A-201ENST00000397560 9272 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 YEATS2-201ENST00000305135 6506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 FN1-202ENST00000336916 8435 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 CLTC-202ENST00000393043 5292 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 ZNF140-202ENST00000355557 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 WT1-AS-201ENST00000395900 3828 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 TAGLN-207ENST00000532870 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 RFX5-202ENST00000368870 2459 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 LDHAL6A-201ENST00000280706 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 ITGAL-201ENST00000356798 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 AC106820.4-201ENST00000561847 5616 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 LEPROTL1-201ENST00000321250 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 POLE-207ENST00000535270 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 PNPO-217ENST00000642017 3465 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 CAMSAP1-202ENST00000389532 7696 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 FMNL3-205ENST00000550488 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 SLC47A1-201ENST00000270570 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 MYT1L-204ENST00000428368 4850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 ODF2-213ENST00000448249 2059 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 TGM7-201ENST00000452443 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 STAT6-202ENST00000454075 3037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 SLC39A13-204ENST00000524928 3553 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 MCU-204ENST00000536019 3224 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 IKBKE-201ENST00000578328 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 MAP2K3-214ENST00000613338 2029 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 SCN5A-202ENST00000333535 8456 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 TP53I11-220ENST00000533940 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 TNFRSF8-201ENST00000263932 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 HINT3-201ENST00000229633 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 PRPF40B-209ENST00000548825 3307 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 DLGAP2-201ENST00000421627 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 RIMKLA-202ENST00000431473 8909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 SLC13A4-201ENST00000354042 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 PARP3-202ENST00000417220 2472 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 CA14-201ENST00000369111 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 REC8-213ENST00000620473 2405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 POC5-202ENST00000428202 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 KCNAB2-201ENST00000164247 4273 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 MCM3AP-201ENST00000291688 6193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 CAPN10-AS1-201ENST00000567819 4000 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 CACNA1F-202ENST00000376251 5813 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 BAIAP3-215ENST00000568887 3763 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 CCT3-211ENST00000472765 1858 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 AC005906.2-201ENST00000640877 3408 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 TMF1-201ENST00000398559 6849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 RBM33-207ENST00000401878 10149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 AC010969.2-201ENST00000602458 3231 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
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