Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
NPTX1Q15818 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
NPTX1Q15818 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
NPTX1Q15818 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
NPTX1Q15818 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
NPTX1Q15818 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
NPTX1Q15818 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
NPTX1Q15818 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
NPTX1Q15818 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
NPTX1Q15818 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
NPTX1Q15818 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
NPTX1Q15818 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
NPTX1Q15818 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
NPTX1Q15818 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
NPTX1Q15818 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
NPTX1Q15818 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
NPTX1Q15818 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
NPTX1Q15818 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
NPTX1Q15818 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
NPTX1Q15818 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
NPTX1Q15818 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
NPTX1Q15818 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
NPTX1Q15818 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
NPTX1Q15818 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
NPTX1Q15818 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
NPTX1Q15818 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
NPTX1Q15818 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
NPTX1Q15818 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
NPTX1Q15818 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
NPTX1Q15818 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
NPTX1Q15818 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
NPTX1Q15818 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
NPTX1Q15818 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
NPTX1Q15818 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
NPTX1Q15818 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
NPTX1Q15818 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
NPTX1Q15818 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
NPTX1Q15818 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
NPTX1Q15818 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
NPTX1Q15818 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
NPTX1Q15818 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
NPTX1Q15818 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.15□□□□□ -0.14
NPTX1Q15818 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
NPTX1Q15818 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
NPTX1Q15818 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
NPTX1Q15818 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
NPTX1Q15818 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
NPTX1Q15818 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
NPTX1Q15818 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
NPTX1Q15818 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
NPTX1Q15818 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
NPTX1Q15818 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
NPTX1Q15818 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
NPTX1Q15818 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
NPTX1Q15818 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC14.15□□□□□ -0.14
NPTX1Q15818 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
NPTX1Q15818 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
NPTX1Q15818 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
NPTX1Q15818 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
NPTX1Q15818 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
NPTX1Q15818 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
NPTX1Q15818 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
NPTX1Q15818 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
NPTX1Q15818 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
NPTX1Q15818 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
NPTX1Q15818 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
NPTX1Q15818 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
NPTX1Q15818 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
NPTX1Q15818 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
NPTX1Q15818 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
NPTX1Q15818 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
NPTX1Q15818 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
NPTX1Q15818 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
NPTX1Q15818 CFAP65-203ENST00000409865 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
NPTX1Q15818 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
NPTX1Q15818 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
NPTX1Q15818 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
NPTX1Q15818 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
NPTX1Q15818 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
NPTX1Q15818 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
NPTX1Q15818 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
NPTX1Q15818 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
NPTX1Q15818 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
NPTX1Q15818 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
NPTX1Q15818 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
NPTX1Q15818 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
NPTX1Q15818 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC14.14□□□□□ -0.15
NPTX1Q15818 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
NPTX1Q15818 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
NPTX1Q15818 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC14.14□□□□□ -0.15
NPTX1Q15818 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
NPTX1Q15818 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
NPTX1Q15818 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
NPTX1Q15818 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC14.14□□□□□ -0.15
NPTX1Q15818 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
NPTX1Q15818 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
NPTX1Q15818 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
NPTX1Q15818 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
NPTX1Q15818 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
NPTX1Q15818 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
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