Protein–RNA interactions for Protein: Q15438

CYTH1, Cytohesin-1, humanhuman

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Length 398 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH1Q15438 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
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CYTH1Q15438 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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CYTH1Q15438 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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CYTH1Q15438 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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