Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NFIXQ14938 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NFIXQ14938 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NFIXQ14938 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NFIXQ14938 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NFIXQ14938 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NFIXQ14938 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NFIXQ14938 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NFIXQ14938 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NFIXQ14938 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NFIXQ14938 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NFIXQ14938 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NFIXQ14938 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NFIXQ14938 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NFIXQ14938 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NFIXQ14938 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NFIXQ14938 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NFIXQ14938 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NFIXQ14938 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NFIXQ14938 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NFIXQ14938 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NFIXQ14938 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NFIXQ14938 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NFIXQ14938 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NFIXQ14938 HLA-DMA-203ENST00000395305 777 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
NFIXQ14938 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NFIXQ14938 IZUMO1R-202ENST00000440961 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NFIXQ14938 AL354861.1-201ENST00000445213 355 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
NFIXQ14938 RPS25-202ENST00000527673 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NFIXQ14938 NEU3-207ENST00000534628 746 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NFIXQ14938 CR383656.3-201ENST00000551315 183 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
NFIXQ14938 AC068397.2-201ENST00000558742 341 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NFIXQ14938 NPTN-204ENST00000562924 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NFIXQ14938 LINC02176-201ENST00000569104 598 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NFIXQ14938 MIR5196-201ENST00000578146 115 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
NFIXQ14938 TMEM98-205ENST00000578289 806 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NFIXQ14938 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NFIXQ14938 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NFIXQ14938 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NFIXQ14938 NTF3-202ENST00000423158 1336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NFIXQ14938 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NFIXQ14938 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NFIXQ14938 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NFIXQ14938 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NFIXQ14938 METTL7B-202ENST00000614691 1368 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NFIXQ14938 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NFIXQ14938 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NFIXQ14938 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NFIXQ14938 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NFIXQ14938 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NFIXQ14938 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NFIXQ14938 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NFIXQ14938 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NFIXQ14938 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NFIXQ14938 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NFIXQ14938 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NFIXQ14938 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NFIXQ14938 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NFIXQ14938 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NFIXQ14938 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NFIXQ14938 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NFIXQ14938 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NFIXQ14938 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
NFIXQ14938 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NFIXQ14938 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NFIXQ14938 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NFIXQ14938 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NFIXQ14938 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NFIXQ14938 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NFIXQ14938 C8G-201ENST00000224181 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NFIXQ14938 LY86-201ENST00000230568 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NFIXQ14938 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NFIXQ14938 TOMM20L-201ENST00000360945 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NFIXQ14938 TRBJ2-6-201ENST00000390418 53 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NFIXQ14938 INS-IGF2-202ENST00000397270 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NFIXQ14938 AC004837.1-201ENST00000446267 564 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
NFIXQ14938 ZAP70-202ENST00000451498 1085 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NFIXQ14938 PPOX-204ENST00000462866 473 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NFIXQ14938 REEP5-205ENST00000504247 480 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NFIXQ14938 AC107463.1-201ENST00000508605 667 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NFIXQ14938 REEP5-207ENST00000513339 1139 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NFIXQ14938 C2orf69P1-201ENST00000563532 1093 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
NFIXQ14938 RN7SL470P-201ENST00000583069 259 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
NFIXQ14938 RELL1-201ENST00000314117 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NFIXQ14938 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
NFIXQ14938 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NFIXQ14938 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NFIXQ14938 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NFIXQ14938 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NFIXQ14938 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NFIXQ14938 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NFIXQ14938 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NFIXQ14938 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
NFIXQ14938 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NFIXQ14938 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NFIXQ14938 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NFIXQ14938 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NFIXQ14938 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NFIXQ14938 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NFIXQ14938 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
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