Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 C19orf12-209ENST00000623113 4242 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 MAP3K12-203ENST00000547035 2944 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 CACNA1G-207ENST00000429973 7120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 CACNA1G-217ENST00000507336 7116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 AC125611.4-201ENST00000553259 4166 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 CHMP7-202ENST00000397677 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 AL590644.1-201ENST00000412427 4676 ntTSL 4 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 SMC6-201ENST00000351948 5173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 GRIN1-207ENST00000371560 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 MAP4K2-201ENST00000294066 7178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 ZNF501-205ENST00000620116 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 MEX3B-202ENST00000558133 4333 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 FBN1-201ENST00000316623 11756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 MTMR4-204ENST00000579925 5622 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 PWWP2A-202ENST00000456329 3991 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 SYNCRIP-201ENST00000355238 6449 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 GIPC3-201ENST00000322315 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 CNTNAP5-202ENST00000431078 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 SPOUT1-201ENST00000361256 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 FAM157A-203ENST00000634862 6083 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 ROBO1-212ENST00000618833 7492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 TP53INP2-202ENST00000374810 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 MAOA-204ENST00000542639 5438 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 HS3ST1-201ENST00000002596 8031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 CES1P1-201ENST00000421606 1704 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 PLEKHG2-206ENST00000458508 3898 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 NRROS-201ENST00000328557 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
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