Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCARF1Q14162 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCARF1Q14162 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCARF1Q14162 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCARF1Q14162 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCARF1Q14162 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCARF1Q14162 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCARF1Q14162 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCARF1Q14162 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCARF1Q14162 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCARF1Q14162 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCARF1Q14162 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SCARF1Q14162 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SCARF1Q14162 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCARF1Q14162 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCARF1Q14162 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCARF1Q14162 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCARF1Q14162 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SCARF1Q14162 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCARF1Q14162 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCARF1Q14162 AC079416.2-201ENST00000625035 1193 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SCARF1Q14162 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SCARF1Q14162 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCARF1Q14162 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCARF1Q14162 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCARF1Q14162 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCARF1Q14162 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCARF1Q14162 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCARF1Q14162 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCARF1Q14162 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCARF1Q14162 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCARF1Q14162 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCARF1Q14162 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCARF1Q14162 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCARF1Q14162 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCARF1Q14162 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCARF1Q14162 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCARF1Q14162 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCARF1Q14162 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCARF1Q14162 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCARF1Q14162 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCARF1Q14162 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCARF1Q14162 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCARF1Q14162 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCARF1Q14162 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCARF1Q14162 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCARF1Q14162 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCARF1Q14162 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCARF1Q14162 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCARF1Q14162 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCARF1Q14162 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCARF1Q14162 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCARF1Q14162 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCARF1Q14162 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCARF1Q14162 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCARF1Q14162 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCARF1Q14162 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCARF1Q14162 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCARF1Q14162 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCARF1Q14162 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCARF1Q14162 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCARF1Q14162 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCARF1Q14162 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCARF1Q14162 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCARF1Q14162 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCARF1Q14162 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCARF1Q14162 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SCARF1Q14162 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCARF1Q14162 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SCARF1Q14162 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCARF1Q14162 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCARF1Q14162 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCARF1Q14162 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCARF1Q14162 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCARF1Q14162 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SCARF1Q14162 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SCARF1Q14162 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SCARF1Q14162 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCARF1Q14162 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SCARF1Q14162 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SCARF1Q14162 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCARF1Q14162 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCARF1Q14162 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCARF1Q14162 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCARF1Q14162 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCARF1Q14162 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCARF1Q14162 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCARF1Q14162 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCARF1Q14162 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCARF1Q14162 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCARF1Q14162 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCARF1Q14162 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCARF1Q14162 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCARF1Q14162 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCARF1Q14162 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCARF1Q14162 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCARF1Q14162 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCARF1Q14162 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCARF1Q14162 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCARF1Q14162 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
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