Protein–RNA interactions for Protein: Q13972

RASGRF1, Ras-specific guanine nucleotide-releasing factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGRF1Q13972 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RASGRF1Q13972 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RASGRF1Q13972 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RASGRF1Q13972 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RASGRF1Q13972 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RASGRF1Q13972 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RASGRF1Q13972 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
RASGRF1Q13972 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RASGRF1Q13972 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RASGRF1Q13972 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RASGRF1Q13972 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RASGRF1Q13972 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RASGRF1Q13972 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RASGRF1Q13972 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RASGRF1Q13972 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RASGRF1Q13972 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RASGRF1Q13972 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RASGRF1Q13972 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RASGRF1Q13972 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RASGRF1Q13972 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RASGRF1Q13972 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RASGRF1Q13972 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RASGRF1Q13972 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RASGRF1Q13972 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
RASGRF1Q13972 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
RASGRF1Q13972 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RASGRF1Q13972 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RASGRF1Q13972 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RASGRF1Q13972 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RASGRF1Q13972 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RASGRF1Q13972 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RASGRF1Q13972 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RASGRF1Q13972 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RASGRF1Q13972 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RASGRF1Q13972 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RASGRF1Q13972 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RASGRF1Q13972 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RASGRF1Q13972 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RASGRF1Q13972 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RASGRF1Q13972 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RASGRF1Q13972 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
RASGRF1Q13972 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RASGRF1Q13972 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RASGRF1Q13972 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RASGRF1Q13972 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RASGRF1Q13972 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RASGRF1Q13972 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RASGRF1Q13972 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RASGRF1Q13972 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RASGRF1Q13972 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RASGRF1Q13972 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RASGRF1Q13972 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RASGRF1Q13972 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RASGRF1Q13972 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RASGRF1Q13972 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RASGRF1Q13972 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RASGRF1Q13972 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RASGRF1Q13972 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RASGRF1Q13972 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RASGRF1Q13972 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RASGRF1Q13972 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
RASGRF1Q13972 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
RASGRF1Q13972 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RASGRF1Q13972 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RASGRF1Q13972 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RASGRF1Q13972 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
RASGRF1Q13972 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RASGRF1Q13972 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RASGRF1Q13972 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
RASGRF1Q13972 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RASGRF1Q13972 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
RASGRF1Q13972 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
RASGRF1Q13972 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RASGRF1Q13972 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RASGRF1Q13972 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RASGRF1Q13972 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RASGRF1Q13972 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RASGRF1Q13972 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RASGRF1Q13972 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RASGRF1Q13972 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RASGRF1Q13972 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RASGRF1Q13972 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RASGRF1Q13972 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
RASGRF1Q13972 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RASGRF1Q13972 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RASGRF1Q13972 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RASGRF1Q13972 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RASGRF1Q13972 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RASGRF1Q13972 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RASGRF1Q13972 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RASGRF1Q13972 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RASGRF1Q13972 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RASGRF1Q13972 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RASGRF1Q13972 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RASGRF1Q13972 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RASGRF1Q13972 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RASGRF1Q13972 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RASGRF1Q13972 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RASGRF1Q13972 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RASGRF1Q13972 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
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