Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
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ITGA9Q13797 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
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ITGA9Q13797 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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ITGA9Q13797 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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ITGA9Q13797 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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ITGA9Q13797 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
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ITGA9Q13797 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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ITGA9Q13797 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
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ITGA9Q13797 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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