Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
APOFQ13790 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
APOFQ13790 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
APOFQ13790 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
APOFQ13790 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
APOFQ13790 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC14.01□□□□□ -0.17
APOFQ13790 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
APOFQ13790 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
APOFQ13790 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
APOFQ13790 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC14.01□□□□□ -0.17
APOFQ13790 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
APOFQ13790 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
APOFQ13790 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
APOFQ13790 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
APOFQ13790 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC14.01□□□□□ -0.17
APOFQ13790 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
APOFQ13790 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
APOFQ13790 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
APOFQ13790 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
APOFQ13790 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
APOFQ13790 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
APOFQ13790 SNAP91-215ENST00000521743 4263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
APOFQ13790 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
APOFQ13790 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
APOFQ13790 MAGED4B-201ENST00000335504 2578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
APOFQ13790 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
APOFQ13790 RIN3-201ENST00000216487 3859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
APOFQ13790 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
APOFQ13790 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
APOFQ13790 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
APOFQ13790 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
APOFQ13790 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
APOFQ13790 CAPN14-202ENST00000403897 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
APOFQ13790 PSIP1-203ENST00000380733 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
APOFQ13790 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
APOFQ13790 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
APOFQ13790 GAPVD1-205ENST00000394084 3190 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
APOFQ13790 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
APOFQ13790 PCDHA2-202ENST00000520672 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
APOFQ13790 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
APOFQ13790 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC14□□□□□ -0.17
APOFQ13790 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
APOFQ13790 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
APOFQ13790 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
APOFQ13790 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
APOFQ13790 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
APOFQ13790 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
APOFQ13790 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
APOFQ13790 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
APOFQ13790 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
APOFQ13790 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
APOFQ13790 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
APOFQ13790 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
APOFQ13790 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
APOFQ13790 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC14□□□□□ -0.17
APOFQ13790 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC14□□□□□ -0.17
APOFQ13790 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
APOFQ13790 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
APOFQ13790 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
APOFQ13790 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC14□□□□□ -0.17
APOFQ13790 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
APOFQ13790 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
APOFQ13790 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
APOFQ13790 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
APOFQ13790 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
APOFQ13790 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
APOFQ13790 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
APOFQ13790 SH2D3C-201ENST00000314830 3124 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
APOFQ13790 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
APOFQ13790 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
APOFQ13790 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
APOFQ13790 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
APOFQ13790 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
APOFQ13790 ABCC6P1-201ENST00000546162 2943 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
APOFQ13790 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
APOFQ13790 REC8-213ENST00000620473 2405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
APOFQ13790 LINC00940-201ENST00000418006 2350 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
APOFQ13790 ARMC5-201ENST00000268314 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
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APOFQ13790 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
APOFQ13790 CD99L2-205ENST00000437787 3493 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
APOFQ13790 C19orf44-203ENST00000594035 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
APOFQ13790 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
APOFQ13790 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
APOFQ13790 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
APOFQ13790 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
APOFQ13790 SPATS2-223ENST00000553127 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
APOFQ13790 CPNE5-202ENST00000393189 2542 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
APOFQ13790 COX6B2-210ENST00000593184 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
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APOFQ13790 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
APOFQ13790 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
APOFQ13790 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
APOFQ13790 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
APOFQ13790 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
APOFQ13790 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
APOFQ13790 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
APOFQ13790 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
APOFQ13790 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
APOFQ13790 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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