Protein–RNA interactions for Protein: Q13639

HTR4, 5-hydroxytryptamine receptor 4, humanhuman

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Length 388 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR4Q13639 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 RPL37A-203ENST00000427280 698 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 KRT18P66-201ENST00000452970 1269 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 RPL37A-206ENST00000456586 401 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 MPZL3-203ENST00000525386 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 C12orf10-207ENST00000549488 840 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 RPL37A-211ENST00000598925 775 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 APOA1-202ENST00000359492 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 CRYBB3-202ENST00000404334 601 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 IGHV3-37-201ENST00000518544 340 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 AQP8-202ENST00000566125 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 PRMT5-AS1-206ENST00000599580 847 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 AC145207.1-201ENST00000415556 691 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
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