Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTCH1Q13635 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTCH1Q13635 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTCH1Q13635 AURKB-201ENST00000316199 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTCH1Q13635 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTCH1Q13635 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTCH1Q13635 LINC01563-201ENST00000456235 750 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTCH1Q13635 TMEM126A-203ENST00000528105 656 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTCH1Q13635 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTCH1Q13635 MIR4472-1-201ENST00000584349 80 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PTCH1Q13635 AC020934.2-201ENST00000592400 456 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTCH1Q13635 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTCH1Q13635 SIGLEC22P-201ENST00000599104 714 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PTCH1Q13635 AC005759.1-202ENST00000599416 415 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTCH1Q13635 SIGLEC22P-202ENST00000602065 544 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTCH1Q13635 AP003392.6-201ENST00000607709 325 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PTCH1Q13635 AP000322.3-201ENST00000608665 388 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PTCH1Q13635 MYOZ3-209ENST00000615557 1031 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTCH1Q13635 AC073592.2-201ENST00000623062 780 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PTCH1Q13635 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTCH1Q13635 OXA1L-212ENST00000604262 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTCH1Q13635 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTCH1Q13635 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTCH1Q13635 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTCH1Q13635 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTCH1Q13635 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTCH1Q13635 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTCH1Q13635 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTCH1Q13635 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTCH1Q13635 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTCH1Q13635 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTCH1Q13635 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTCH1Q13635 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTCH1Q13635 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTCH1Q13635 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTCH1Q13635 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTCH1Q13635 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTCH1Q13635 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTCH1Q13635 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTCH1Q13635 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTCH1Q13635 OR2V1-201ENST00000329365 948 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTCH1Q13635 C7orf61-201ENST00000332375 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTCH1Q13635 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PTCH1Q13635 RPL18AP8-201ENST00000486071 528 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PTCH1Q13635 AC084752.1-201ENST00000509766 622 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PTCH1Q13635 AL118516.1-201ENST00000564152 670 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PTCH1Q13635 AC104961.2-201ENST00000578129 663 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTCH1Q13635 TREX1-206ENST00000629913 945 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTCH1Q13635 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTCH1Q13635 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTCH1Q13635 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTCH1Q13635 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTCH1Q13635 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PTCH1Q13635 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTCH1Q13635 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTCH1Q13635 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
PTCH1Q13635 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTCH1Q13635 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTCH1Q13635 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTCH1Q13635 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTCH1Q13635 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTCH1Q13635 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTCH1Q13635 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTCH1Q13635 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTCH1Q13635 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTCH1Q13635 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PTCH1Q13635 GON7-201ENST00000306954 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PTCH1Q13635 TTPAL-203ENST00000372906 1139 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PTCH1Q13635 CELP-201ENST00000411440 1249 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PTCH1Q13635 AL390778.2-201ENST00000420883 886 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PTCH1Q13635 AC156455.1-203ENST00000423999 893 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PTCH1Q13635 SUMF2-210ENST00000437307 947 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PTCH1Q13635 AC245884.1-201ENST00000457113 529 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PTCH1Q13635 AC024293.1-201ENST00000467930 498 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
PTCH1Q13635 ATP1A4-205ENST00000470705 886 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PTCH1Q13635 AC068867.1-201ENST00000559855 150 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
PTCH1Q13635 AC135782.2-201ENST00000562040 472 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PTCH1Q13635 AC010422.5-201ENST00000597961 585 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PTCH1Q13635 AC006158.1-201ENST00000610661 249 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
PTCH1Q13635 AC002044.2-201ENST00000624910 970 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
PTCH1Q13635 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PTCH1Q13635 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PTCH1Q13635 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PTCH1Q13635 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PTCH1Q13635 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PTCH1Q13635 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PTCH1Q13635 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PTCH1Q13635 ERCC1-208ENST00000589165 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PTCH1Q13635 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTCH1Q13635 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTCH1Q13635 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTCH1Q13635 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTCH1Q13635 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTCH1Q13635 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTCH1Q13635 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTCH1Q13635 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTCH1Q13635 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTCH1Q13635 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTCH1Q13635 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTCH1Q13635 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
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