Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
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